1986港龍航空英文名稱由香港港龍航空變更為港龍航空，中文名稱不變。1987，港龍航空成為首家以香港為基地，加入國際航空運輸協會(IATA)的航空公司。1989 165438+10月，包玉剛將其持有的港龍航空38%股權出售給曹光標。1990年6月，國泰及太古集團向曹實收購港龍航空35%股權，中信泰富收購38%。1991年，港龍航空購買漢莎餐飲服務(香港)有限公司航空配餐廚房40%股份；1992買入國際航空服務(香港)公司(IAS)30%股份，1994買入剩余70%股份，更名為“香港國際機場服務有限公司”(HIAS)。
1995，港龍航空與國泰航空合資成立“香港新機場地面服務有限公司”(HAS)，負責停機坪的所有運輸和裝卸工作。在1996期間，國泰航空為了拓展中國市場，向AVIC出售了部分股份。AVIC獲得35.86%的股份，成為港龍航空第壹大股東，中信泰富緊隨其後，占28.5%，太古/國泰占25.5%，曹氏家族占5.02%。同年，港龍航空與大廠成立“大廠:港龍航空機場地面設備服務有限公司”，提供地面設備維修保養服務。
1997港龍航空成立貨運服務部，不再使用國泰航空貨運服務作為總代理。此外，AVIC集團旗下的AVIC興業在港上市，其持有的港龍航空股份全部由母公司轉讓。加上曹氏家族和另壹名股東轉讓的7.43%的股份，AVIC興業擁有港龍航空43.29%的股份。後期雖然國泰是港龍的股東之壹，但港龍也推出了與國泰直接競爭的航線，比如香港往返臺北、東京、曼谷的航線，國泰也推出了北京往返廈門的航線，與港龍直接競爭。2006年6月9日，國泰航空發表聲明稱，已與其他相關公司就收購港龍航空達成協議。國泰航空將以82.2億港元及新股(占股90%)從港龍航空其他股東手中收購港龍航空。另有40.7億元用於增持中國國際航空股份，由65，438+00%增至20%。另壹方面，國航以53.9億元買入國泰航空10.16%股權，形成國航與國泰航空的相互控制關系。
同年9月28日，港龍航空正式成為國泰航空的全資附屬公司，並宣布裁減191名員工。自1985成立以來，港龍航空的航線已從東南亞單壹城市擴展至亞洲大部分主要城市。港龍航空首航哥打基納巴盧後，1986開始泰國普吉島航線，並增加至中國大陸6個城市的包機服務，解決了港龍航空因港府當時堅持壹條航線壹家航空公司的政策而無法在主要地點飛行的問題。1990' s期間，由於只有港龍航空提供臺灣省經香港到中國大陸的兩岸航班服務，所以主要發展大陸航線業務。
1998年7月，赤角新香港國際機場啟用前，港龍客機成為最後壹班降落啟德機場的定期航班。1999年5月，港龍航空從上海飛往香港的航班成為首個降落在香港國際機場第二跑道的定期航班。2000年3月，港龍航空的所有航線都轉為定期航班；同年7月，港龍航空拓展業務，推出往返中東和歐洲的貨運航班。2000年代，港龍航空繼續運營飛往亞洲各地的客運航班。2004年4月2日，它開始每周7次往返日本東京的客運航班。以及飛往歐洲和美國的貨運航班。2005年4月2日，每周三次貨運航班飛往紐約肯尼迪國際機場。
港龍航空與國泰航空合並後，重組航線，取消往返曼谷的航班，恢復運營至普吉島，即開通至釜山的航班。目前，港龍航空與中國國際航空公司、中國南方航空公司、馬來西亞航空公司和文萊皇家航空公司實行代碼共享。2006年6月5438+2月1日起，與國泰航空公司在往返北京、上海、廈門、東京、普吉島、釜山和亞庇的航班上實行代碼共享。
在首航中，港龍航空只有壹架波音737-200。在擴大業務後，它開始增加飛機數量，並推出不同類型的飛機。1993年3月，港龍航空加入空客A320，而A330於7月加入1995。2000年租了壹架波音747-200貨機跑貨運航班，2001年買了兩架波音747-300貨機。2004年，客機機隊增至26架，2005年5月5日接收的空客A330-300機身塗有特殊圖案，以慶祝20周年。2002年6月8日，港龍航空壹架編號為KA890的空客A321客機從香港飛往上海，抵達上海虹橋機場。起落架正常放下後，飛機降落在跑道上，左後輪胎突然爆裂。幸運的是，沒有人受傷。
2003年7月18日，壹架由馬來西亞飛往香港、編號為KA060的港龍航空航班緊急迫降，機上9人受傷，包括7名機組人員和2名乘客。
2004年6月27日，165438+港龍航空壹架由昆明飛往香港，編號為KA761的空客320航班，起飛後發現前風擋玻璃右下角有壹條約5厘米的裂縫。起飛15分鐘後緊急折返，安全降落昆明機場。
2005年6月22日65438+10月22日，港龍航空壹架編號為KA925的空客320客機從大連飛往香港。起飛約1.5小時後，駕駛艙風擋玻璃多層保護膜中的壹層出現裂紋。機師要求赤角機場控制塔采取預防措施，飛機最終安全降落。
2005年7月22日，港龍航空壹架航班號為KA363的空客A330-300客機從東京飛往香港。在飛行過程中，有乘客發現壹臺發動機“在沒有引擎蓋的情況下飛行”，懷疑襟翼導向整流罩在飛行過程中脫落。民航處澄清:「根據飛機營運者港龍航空提供的資料，襟翼導軌整流罩在最近壹次例行檢查後被拆除維修。整流罩的作用是減少風阻，節省燃油。拆除整流罩不會影響飛行安全。”
2006年7月29日，壹架空客A330，編號KA2362，由香港飛往東京，載有275名乘客和機組人員，飛行高度為香港以東110海裏。當時，壹架編號為NW002的西北航空747正在飛往東京的途中，疑似因躲避惡劣天氣而未經批準改變了航線。港龍航空準備爬升時，機長通過雷達發現航道上有另壹架飛機。兩架飛機最接近時，縱橫距離只有300英尺3.5海裏，遠低於1000英尺5海裏的安全要求。港龍機長實時停止爬升，改變方向，拉大了兩架飛機的距離，沒有釀成災難。5天後，飛往上海的貨機KA590是壹架空客A300B4，由其他航空公司包租。在香港起飛壹個多小時後，機師指出機上兩個引擎都缺乏動力，必須在“全面戒備”狀態下回港。航班最終安全著陸，機上4名機組人員安全。