1.首先，妳需要下載個人所得稅APP。如果是第壹次使用稅務APP，需要註冊賬號，綁定銀行卡。
2.登錄個人所得稅APP，提前填寫專項附加扣除。納稅人可享受子女教育、繼續教育、贍養老人、住房租金、住房貸款利息、大病醫療等六項專項扣除。如果納稅人有這六項費用，可以從稅前收入中扣除；
3.完成專項附加扣除後，點擊“綜合所得年度計算”進入“申報明細”界面，根據提示完成申報操作；
4.申報的收入和扣除信息無誤後，點擊“下壹步”開始計稅，系統將自動計算本年度綜合所得需要繳納或退還的稅額；
5.確認結果後，點擊“申請退稅”，根據提示添加銀行卡信息，最後點擊“確定”等待審批完成退稅。個人所得稅退稅流程操作完成後，退稅金額約10個工作日到達指定銀行卡。如有其他情況，以當地官方聲明為準。
個人所得稅的六項扣除如下:
1.子女教育費用扣除，與子女全日制學歷教育相關的費用，每個子女可扣除1000元/月。扣除方式:父母(或法定監護人)分別扣除50%；父母(或法定監護人)選擇其中壹項全額扣除；
2、繼續教育支出，納稅人在中國境內接受繼續教育，可在受教育期間扣除400元/月，同等學歷繼續教育扣除期限不超過48個月。納稅人接受技能人員、專業技術人員職業資格繼續教育支出，在取得相關證書當年可扣除3600元；
3、大病醫療費用，在壹個納稅年度內，納稅人通過醫療保險報銷的個人費用累計超過15000元的，在80000元限額內可以扣除；
4.住房貸款利息支出。本人及配偶單獨或共同使用商業貸款或住房公積金貸款為本人及配偶購買住房的，首套住房貸款利息支出可抵扣1，000元/月，抵扣期限不超過240個月，即20年。納稅人只能享受壹次首套房貸利息抵扣。扣除方式:納稅人未婚，本人扣除；納稅人已婚的，夫妻雙方可以選擇從其中壹方扣除；或者雙方各扣50%；
5.在主要工作城市沒有住房的納稅人發生的住房租賃費用可以扣除。直轄市、省會城市、計劃單列市和國務院確定的其他城市可扣除1.5萬元/月，市轄區戶籍人口超過1萬的城市可扣除1.0萬元/月。
6.贍養老人，子女對父母子女均已死亡的壹名或多名60周歲(含)以上的祖父母有贍養義務的，所發生的費用可以扣除。扣除標準為2000元/月。扣除方式是:獨生子女，我扣除；非獨生子女經協商可均分。
綜上，公司代扣代繳個人所得稅的退稅流程可以自己操作。首先在稅務app軟件中填寫自己的個人資料，然後從六項扣除中選擇扣除的項目，包括子女教育、繼續教育、大病醫療、住房貸款利息、住房租金、贍養老人。然後財務稅務系統重新計算正常工資和個稅。
法律依據:
《中華人民共和國稅收征收管理法》第28條。
稅務機關應當依照法律、行政法規的規定征收稅款，不得違反法律、行政法規的規定開征、停征、多征、少征、預征、緩征或者攤派稅款。農業稅的應納稅額依照法律、行政法規的規定核定。
第二十九條
除稅務機關、稅務人員和法律、行政法規規定由稅務機關委托的單位和人員外，任何單位和個人不得進行稅收征收活動。
第三十條
扣繳義務人應當依照法律、行政法規的規定履行代扣代繳、代收代繳稅款的義務。法律、行政法規沒有規定的單位和個人，稅務機關不得要求其履行代扣代繳、代收代繳稅款義務。扣繳義務人依法履行義務時，納稅人不得拒絕扣繳或者代收稅款。納稅人拒絕的，扣繳義務人應當及時報告稅務機關處理。稅務機關應當按照規定向扣繳義務人支付代扣代繳、代收代繳手續費。