具體操作上，目前各家企業應該都是使用自然人稅收管理系統申報員工個人所得稅，在完成人員信息報送和獲取反饋後，選擇綜合所得申報，再選擇正常工資薪金，選擇需要申報的納稅人填寫他的報表，怎麽記的賬就怎麽填，如果工資為零但是社保金存在，那就在社保費欄次如實填寫社保費，其它為零，選擇上方第四步報表報送，點擊發送申報輸入申報密碼即可完成申報操作。
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很高興回答妳的提問： 員工工資為零，單位只繳納社保，該如何申報個稅？
企業申報繳納的社保，分為單位應承擔部分與個人應承擔的部分。所謂員工工資為零，企業承擔社保，要分以下情況：
企業只承擔繳納的社保費用中由企業承擔的部分，應由員工個人承擔的社保部分，個人需要以現金形式交給企業，或者從後期工資裏扣除，這是真正意義上的零工資。
假設： 該企業當月為該員工繳納社保1361.53元，其應由個人承擔部分為361.53元，需要員工當月將對應的現金交給企業，則當月該員工的工資為零元。
會計處理如下：
1）計提該員工應由企業承擔的社保
借：管理費用-社保 1000元（企業承擔社保）
貸：應付職工薪酬-社保 1000元（企業承擔社保）
2）企業繳納該員工的社保
借：應付職工薪酬-社保 1000元（企業承擔社保）
其他應收款-員工 361.53元（個人承擔社保）
貸：銀行存款 1361.53元
3）員工繳納個人承擔的社保對應的現金
借：庫存現金 361.53元
貸：其他應收款--員工 361.53元（個人承擔社保）
4）個稅申報
次月申報該員工個稅時，其“累計收入”為企業上月為其申報的收入數，如果員工是第壹個月入職，則其”累計收入“為零。
企業承擔社保，不僅僅承擔繳納的社保中由企業承擔的部分，應由員工個人承擔的社保部分，企業也不再收取現金或者在後期扣發，而是由企業全額繳納。
假設： 該企業當月為該員工繳納社保1361.53元，其應由個人承擔部分為361.53元，但其個人應承擔部分由企業承擔，實則當月該員工的工資為361.53元，而不是零元。
我們通過會計分錄分析可以更明了清晰：
1）計提該員工應由企業承擔的社保
借：管理費用-社保 1000元（企業承擔社保）
貸：應付職工薪酬-社保 1000元（企業承擔社保）
2）企業繳納該員工社保的會計分錄
借：應付職工薪酬-社保 1000元（企業承擔社保）
應付職工薪酬-工資薪金 361.53元（個人承擔社保）
貸：銀行存款 1361.53元
3）企業負擔該員工社保，實則是企業將該員工應承擔的社保金額直接作為工資金額，直接扣除，應作如下會計分錄
借：管理費用-工資薪金 361.53元
貸：應付職工薪酬-工資薪金 361.53元（個人承擔社保）
通過以上會計分錄可以看出，該員工當月工資薪金應為361.53元，只不過扣除361.53元應由個人承擔的社保金額後，實發為零，造成其當月工資為零的假象。
因此，企業在為該員工進行工資薪金所得個人所得稅扣繳申報時，其“累計收入”為企業“上月為其申報的收入數+361.53元”；如果員工是第壹個月入職，則其”累計收入“為361.53元。
某些企業因為經營原因，數月不發工資，但正常申報繳納社保。這種情況下，每月申報納稅時，應如何進行個稅申報？
假設： 企業某員工每月工資8000元，因特殊原因，企業平常不發放其工資，只是每月為其繳納社保3000元，其應由個人承擔部分為950元。
企業會在年末將工資扣除累計繳納的社保後，壹次性發放給該員工。
這種情況下，該企業每月為該員工申報工資薪金所得個稅時，應按照每月工資950元為其申報納稅，而不是零元工資。
我們通過會計分錄分析如下：
1）員工工資為8000元，會計應計提工資
借：管理費用-工資薪金 8000元
貸：應付職工薪酬-工資薪金 8000元
2）計提該員工應由企業承擔的社保
借：管理費用--社保 2050元（企業承擔社保）
貸：應付職工薪酬--社保 2050元（企業承擔社保）
3）繳納社保
借：應付職工薪酬-工資薪金 950（個人承擔社保）
應付職工薪酬-工資薪金 2050（企業承擔社保）
貸：銀行存款 3000元
通過以上會計分錄，我們可以看到，企業繳納該員工社保後，雖然沒有為該員工發放現金工資，但企業應支付給該員工的工資薪金余額已經變為7050元，說明該員工應由個人承擔的社保金額對應的工資已經產生資金的流出，即該部分工資已發放。
因此本月申報時，雖然貌似沒有為該員工發放工資，但實際應將本月由個人承擔的社保金額作為本月工資薪金金額進行個稅申報，而不是申報零工資。
這種情況在實際工作中是很少見的，通常在兩種情況下會存在員工工資為0的情況。
壹種是該人員社保在第三方公司掛靠的 ，並且需要申報個稅的，這種情況下第三方公司只負責為該人員繳納社保，沒有任何的工資流水，可以理解工資為0，這種情況下申報個稅時應納稅額為0，至於應納稅所得額應該填多少就需要仔細斟酌，能少填就少填，只要低於5000都是無需繳納個稅的，但是2019年1月開始個稅就使用新的稅制，采用合並計稅的方法，合並的項目包括“ 工資薪金，勞務報酬，稿酬，特許權使用費 ”四項。
如果員工實際工資為0，但在其他地方取得其他報酬，這樣壹來申報個稅時的基數太高，在次年的匯算清繳時有可能會導致該人員補稅的情況， 所以在工資為0的情況下個稅申報基數建議設置在當地最低工資標準以上5000元以下 ，申報基數為包含了職工個人承擔部分的社保、醫保費用，不包含企業部分。
另壹種情況是該人員為企業職工，但未正常提供勞動，所以實際工資為0， 這裏需要註意，實際工資為0的職工企業在為其申報個稅時基數並不為0 ，因為申報個稅基數壹般是員工的應發工資（通常也稱稅前工資），而實際到手為0是指是指實發工資（也稱稅後工資），稅前工資和稅後工資之間的關系為： 稅後工資＝稅前工資-社保個人承擔部分-公積金個人承擔部分—個稅-其他個人承擔部分 。
雖然員工未提供勞動，但為職工繳納社保和公積金屬於企業的義務和責任，因此即便實際工資為0，申報個稅時的基數最少也為社保個人部分費用+公積金的個人部分。
以上均是從合理，合規，合法的角度做的分析，雖然最終的個稅都為0，但申報基數有誤，也會存在潛在的風險。
員工工資為零，單位部分只繳納社保，需要進行個稅申報？
通常情況下，我們都知道，工資為0，相應的個人所得稅肯定是0，自然就是0申報個人所得稅的。但我們在申報前，需要弄清楚，員工的工資為什麽是0？
（1）員工離職造成的工資為0
如果是員工離職了，但沒有立馬找到下家。跟公司協商後，公司幫忙繳納幾個月的社保的。那給員工申報個人所得稅時，直接在稅控系統裏進行0申報即可。
（2）員工在職，但因經營原因等造成不發員工當月工資
如果員工在職，但因考核績效或公司經營問題，暫緩發放當月工資，延期1-3月後，再發放的。那這也是可以的。那當月工資為0，也是壹樣0申報個人所得稅就行了。
但如果員工在職，單純不給員工發工資，後續也不補發時，可能會違法勞動法的。因為各地有規定每月發放的工資不能低於當地社保平均工資，有壹個最低工資標準的。
所以，當員工工資為0時，建議先弄清楚工資為0的原因。然後再進行零申報個人所得稅。單位部分社保，正常計入公司社保費即可。
員工工資為零，單位繳納社保的情況可分為兩種：
如果是應發工資為零，則企業的責任只需要繳納社保中企業應繳的部分，員工應繳的個人部分現有企業代繳，做賬時應記入其他應收款，待後續員工歸還該筆款項後方可平賬。申報個稅時在工資部分填零。
如果只是實發工資為零，企業同時承擔社保中的企業和員工兩部分，員工日後不需要向企業歸還款項。則可以在申報個稅時，將該員工的工資額填入其個人本應承擔的社保部分。這樣，經過社保扣減後，該員工的實發工資為零。
個稅員工工資為零，不明白是什麽意思，是指收入低於5000元，還是指零收入？零收入不太可能，難不成為老板做貢獻？
社保，分單位繳納部分和員工繳納部分，按國家規定標準繳納各自應承擔的金額。大多數企業都要給員工繳納五險，好壹點的五險壹金，更好壹點的五險兩金。國企壹般都是五險兩金，私企麽，看老板大方了。
個人所得稅涵蓋面甚廣，在國家的財政收入中占有重要的比重。它包括工資、薪酬所得；稿酬所得；勞動報酬所得；特許權使用費所得；經營所得；利息、股息、紅利所得；財產租賃所得；偶然所得（中彩票之類的）；其他所得。
企業員工的個人所得稅來源，多是來自薪酬。員工薪酬包括工資、獎金、津貼和補貼；五險壹金；福利費；非貨幣性福利（物品之類的）......個人所得稅的起征點為5000元，有七檔稅率。
應納稅所得額=月收入-5000元(起征點)-專項扣除(三險壹金等)-專項附加扣除-依法確定的其他扣除
月工資收入沒有超出5000元的，達不到扣繳的水平，不用繳稅。相信很多人，都希望自己能達到納稅標準，甚至多多益善。
沒有工資只交社保，個稅申報應把個稅做0申報處理。
社保的繳納是以職工上年平均工資為基數的，也就是說社保的基礎是工資。目前妳們公司在社保登記了給員工發了多少多少工資，在稅務這邊卻做0申報。
雖然現在稅務和社保尚未實現信息***享，但若有壹天***享了，對妳們公司就是大麻煩。稅務會說，為什麽發了工資，妳們卻做0申報，有逃稅嫌疑。
工資，社保，個稅，合同，公積金等是員工所在單位的法律關系。必須壹壹對應，這樣公司才好管理，才能應付勞動監察，應付有關部門的隨時稽核。
申報時所需資料：
根據壹個納稅年度內的所得、應納稅額、已繳（扣）稅額、抵免（扣）稅額、應補（退）稅額等情況，如實填寫並報送《個人所得稅納稅申報表（適用於年所得12萬元以上的納稅人申報）》
個人有效身份證件復印件，以及主管稅務機關要求報送的其他有關資料。有效身份證件，包括納稅人的身份證、護照、回鄉證、軍人身份證件等。
納稅申報時需要填報的信息：壹般只需填寫個人的相關基礎信息、各項所得的年所得額、應納稅額、已繳（扣）稅額、抵免稅額、應補（退）稅額。
個人的相關基礎信息包括姓名、身份證照類型及號碼、職業、任職受雇單位、經常居住地、中國境內有效聯系地址及郵編、聯系電話，如果是外籍人員，除上述內容外，還需填報國籍、抵華日期等信息。
納稅申報表的領取：納稅申報表可以從稅務局網站上免費下載，也可以直接到各地方稅務機關的辦稅大廳免費領取。
通過兼職取得高收入者的申報：從兩處或者兩處以上取得工資、薪金所得的，選擇並固定向其中壹處單位所在地的主管地稅機關申報。
個稅如何申報:
年所得12萬元以上，是指壹個納稅年度內11項所得合計達到12萬元。這11項包括：“工資、薪金所得”、“個體工商戶的生產、經營所得”、“對企事業單位的承包經營、承租經營所得”、
“勞務報酬所得”、“稿酬所得”、“特許權使用費所得”、“利息、股息、紅利所得”、“財產租賃所得”、“財產轉讓所得”、“偶然所得”以及“經國務院財政部門確定征稅的其他所得”。
如果個人在壹個納稅年度內取得所得超過12萬元，無論其平常取得各項所得時是否已足額繳納了個人所得稅，或者是否已向稅務機關進行了自行納稅申報，年度終了後，均應當按《辦法》的有關規定向主管稅務機關辦理納稅申報。
另：年所得12萬元以上，不包括在中國境內無住所，且在壹個納稅年度中在中國境內居住不滿1年的個人。
題主所說個稅如何處理，我這裏理解為個稅如何申報，個稅進行申報時最重要的壹欄為累計收入，即本月申報上月的累計收入。
壹般來說，員工到手工資是實際工資扣除員工個人應繳納社保。
如果題目中所說員工工資為0，是指員工到手工資，那麽說明員工不是沒有工資，而是自己的工資被扣除繳納了社保，這時個稅申報時累計收入壹欄為員工個人應繳納社保的金額；如果題目中所說員工工資為0，是指員工實際工資，那麽累計收入壹欄應該為0，而且員工應該以現金的形式向企業交納企業代為繳納的個人部分社保。
以上為個人理解，有錯誤或者陳述不清楚的地方，敬請諒解。
工資為0的情況下，個稅按照0收入申報即可，但是社保不會因為沒發工資而0申報。社保的申報繳納是以員工人數和基數來確定的，除非妳在社保系統減少繳納人數直至0，否則社保系統不會因為妳工資為0而減免，稅務申報系統的社保數字來源於社保系統，在稅務申報時不能變更的。綜上所述，工資為0和社保繳納沒有直接關系。
工資0申報即可。這個沒問題的。2019年以前比較麻煩，現在改革了。
1、個稅問題；
現在，個稅是按年總收入計算，比如：這個月0元工資，下個月3萬，那麽妳的總個稅額是3萬。關於個稅，國家有相應的政策，網上查有很多發布。
2、改革對中小企業幫助較大；
拿有些創業公司講，員工先不講，先講老板吧，老板工資可以不發，員工不能不發吧？這也是老板與員工的區別，賬上的錢先保證發員工的，公司才能存活下去。所以，老板也是員工，首先老板是O工資的機率最大。這個時候，財務工資就會O申報。
3、0申報與社保無關；
社保歸社保，與工資無關。所以，社保可以穩定的繳納，工資可以0申報，次年的社保基數會以上年的平均工資來算。