二是理順各部門的職責和關系，制定規範的業務流程，加強內控制度建設。存貨內部控制涉及多個部門，包括采購和銷售部門、倉庫部門、生產車間和財務部門。有計劃控制、合同訂立、材料驗收、付款、審核、對賬、清理、材料領料、材料發放、審核、分析等多個控制點。按照存貨的業務流程，可以分為采購、入庫、領用、盤點等多個方面。其中采購和收款是重點，建立完善的存貨內部控制應以采購和收款為重點。要成立專門的材料采購部門，加強材料采購的計劃性，加強材料采購比價招標制度，分離不相容崗位，加強內部審計，加強采購的事前管理，建立健全材料價格信息檔案，建立健全供應商檔案。加強庫存收發存管理制度，庫管員在領料時要嚴格把關，有相應的分析驗收報告，不合格的退回；確保庫存申請的業務記錄真實，收發無誤。要求庫管員在發貨後及時登記庫存賬；會計部根據材料記賬員發料匯總表的用途匯總發放，匯總領料單。采用計劃價格計算材料成本的，月末應分攤材料成本差異，並登記相關賬戶。
第三，制定存貨計價方法，加強存貨核算。企業應根據各類存貨的實際情況、企業管理的要求和存貨的性質，合理選擇發出存貨成本的計價方法，從而合理確定本期發出存貨的實際成本。確定存貨計價方法後，財務部門可以根據各部門收發的單據進行核算，確定存貨成本。在確定存貨成本時，要考慮存貨的采購成本、加工成本和其他成本，根據存貨經濟訂貨量的基本模型，合理確定存貨的合理批量和采購時間，使存貨的總成本最小，達到存貨管理的目的。根據各部門提供的庫存報告，運用正確的成本計算方法，正確結轉產成品成本。對於期末存貨成本的計量，在資產負債表日，應當考慮存貨成本和可變現凈值，以確定是否計提存貨跌價準備。
第四，加強各部門之間的對賬，建立相應的盤點制度，定期進行實地盤點，確保盤點賬目的壹致性。存貨可分為日常存貨、月末存貨和年末存貨。財務部門可以牽頭盤點生產車間的在產品和成品，倉庫的材料和成品，與采購和銷售部門對賬，密切關註材料的暫估和在途情況，及時收集發票，註意各部門之間的審核。