1，企業會計基礎不同。企業會計以權責發生制為基礎，事業單位會計以收付實現制為基礎。比如企業買固定資產，只添資產不花，留著慢慢分享；事業單位購買固定資產，直接記錄支出。資產呢？基金不容忽視。所以在凈資產上設置壹個基金科目來對應資產，就有了“復式”的說法。(改天寫壹篇關於“復式”的文章)
2、企業會計有涉稅內容，壹般事業單位不涉及稅收。所以事業單位會計童紙沒有稅務檢查的麻煩！但是也不要太高興，機構需要和財政部門協商，下面就說。
3.不同的收入來源。企業的收入主要來自客戶，事業單位的收入主要來自同級財政部門，所以事業單位的會計非常需要和財政部門打交道。處理的內容包括:預算編制、資金申請、預算調整、決算和接受監督。
4、企業會計重在核算利潤，事業單位沒有利潤。企業的利潤是自己的，所以叫財務業績；事業單位沒有利潤，只有結轉結余資金，大多是財政資金，不能自由使用，只能叫財政成果。
5、可能面臨不同的監督檢查部門。企業可能面臨的監督檢查部門包括稅務部門、會計師事務所、銀行等。事業單位可能面臨審計部門、財務部門、紀檢監察部門等監督檢查部門。