會計和財務科長的區別在於，會計是職稱，財務科長是職稱。他們從不同的角度被召喚。會計可以是財務部的會計，但是她有會計職稱證，財務科長是財務部的領導，但是她可能沒有會計職稱證，就是這樣的區別。
前者是職稱，後者是職位。壹般大陸用前者作為具有中級會計師的會計師的統稱，港澳臺則指具有註冊會計師證書的會計師。後者來自政府機構的職位。有些企業也用這個稱呼作為職位，更多的企業用主管、經理等稱呼。