《企業會計制度》會計科目較多，***設置五類85個壹級會計科目，二級及三級會計科目74個；而《小企業會計制度》充分考慮了小企業規模小、經濟業務量少、交易簡單的特點，較《企業會計制度》減少了25個壹級會計科目、18個二級及三級會計科目，***設置五類60個壹級會計科目，二級及三級會計科目56個，但是絕大多數科目的名稱與核算內容與《企業會計制度》規定壹致。
1、資產類：庫存現金、銀行存款、其他貨幣資金、交易性金融資產、應收票據、應收賬款、預付賬款、應收股利、應收利息、其他應收款、壞賬準備、材料采購、在途物資、原材料、材料成本差異、庫存商品、商品進銷差價、委托加工物資、周轉材料、存貨跌價準備、債權投資、其他債權投資、長期股權投資、固定資產、累計折舊、固定資產減值準備、在建工程、固定資產清理、工程物資、無形資產、累計攤銷、無形資產減值準備、長期待攤費用、待處理財產損益等；
2、負債類：短期借款、應付票據、應付賬款、預收賬款、應付職工薪酬、應交稅費、應付利息、應付股利、其他應付款、長期借款、長期應付款、預計負債等；3、所有者權益：實收資本、資本公積、盈利公積、本年利潤、利潤分配等；
4、損益類：主營業務收入、其他業務收入、公允價值變動損益、投資收益、營業外收入、主營業務成本、營業稅金及附件、銷售費用、管理費用、財務管理、資產減值損失、營業外支出、所得稅費用、以前年度損益調整、其他業務成本等；
5、成本類：生產成本、勞務成本、工程施工等。