根據西城博物館的民辦性質，本著精簡機構、壹館多用、專兼結合、制度化管理與社會化服務相結合的原則。暫擬設壹室六部:
房間1:辦公室
集政務、館務、事務、票務於壹體的綜合管理與服務部門，負責上傳下達、宣傳落實、協調實施。
六個部分:
1，文保研究部
負責遺址保護、文物保存、保護修復研究、展覽策劃、展品展示、展覽維護、文物收藏。
2.展覽與教育部
負責對外宣傳、營銷、解釋、接待、展覽和展廳工作。組織和策劃展覽會及相關的社會活動。
3.業務發展部
負責館內招商管理工作；負責開發具有西部特色的旅遊紀念品和特色商業活動。
4.安全部門
負責全館文物、財產、觀眾、社會的綜合管理；負責技防、消防以及與公安、消防等部門的聯絡；負責保安工作的監督和安排以及保安公司的協調工作；負責市級以上博物館的接待和內部保衛工作。
5.財會部
負責財務管理和會計核算。
6.俱樂部運營部
負責俱樂部的策劃、營銷、運營、服務、綜合管理和事務。會員的發展和服務；藏品的展示、交流、鑒賞和交易；策劃和組織各種論壇、峰會等活動。