如公司被員工舉報偷稅漏稅，公司應立即進行內部審查，並配合相關部門的調查。如果確實存在偷稅漏稅的情況，公司應及時繳納稅款，並承擔相關罰款。同時，公司需要加強內部管理，確保類似問題不再發生。如舉報不實或無證據證明公司有偷稅行為，公司可向勞動爭議仲裁委員會申請仲裁或向法院提起訴訟。
綜上所述:被員工舉報偷稅漏稅，是需要認真對待的嚴重指控。如有偷稅漏稅，公司應及時繳納稅款，並承擔相關罰款。如果舉報不實或者沒有證據證明公司有偷稅漏稅行為，公司可以通過法律途徑維護自身權益。立即通知稅務機關:公司應立即通知稅務機關，並配合其調查。這包括提供必要的文件和信息，如財務報表、納稅申報表和其他相關文件。
審查公司財務記錄:公司應審查所有相關財務記錄，包括賬簿、發票、收據和其他文件，以確定是否存在逃稅行為。如果有任何可疑的交易或記錄，公司應立即采取措施予以糾正。
聯系法律顧問:公司應該聯系法律顧問，以確保所有行為都符合法律。法律顧問可以幫助公司了解他們的權利和責任，並指導他們采取適當的行動。
調查員工行為:公司應對被舉報的員工進行調查，以查明他們是否參與逃稅。如果員工確實有不當行為，公司應采取適當的行動，如解雇他們或向稅務機關舉報。
加強內部培訓:公司應加強內部培訓，確保所有員工了解公司的財務制度和稅收法規。此外，公司還應提供如何正確填寫納稅申報表以及如何保持準確財務記錄的培訓。
建立內部控制制度:公司應建立完善的內部控制制度，以確保所有財務交易都得到適當的授權和記錄。此外，公司應定期審查其內部控制系統，以確保其有效性。
法律依據:
《中華人民共和國稅收征收管理法》第六十三條規定:“納稅人偽造、變造、隱匿、擅自銷毀賬簿、憑證，或者在賬簿上多列費用或者少列、漏報收入，或者經稅務機關通知後拒不申報、謊報納稅，不繳或者少繳應納稅款的，是偷稅。”
《中華人民共和國稅收征收管理法》第六十四條規定:“納稅人偽造會計憑證、會計賬簿或者隱瞞真實、重要事項，或者有其他不繳、少繳稅款行為的，由稅務機關責令改正，可以處已繳稅款50%以上5倍以下的罰款。”
《中華人民共和國稅收征收管理法》第六十五條規定:“納稅人超過應納稅額未繳的稅款，稅務機關發現後應當立即追繳；納稅人自匯算清繳稅款之日起三年內發現的，可以要求稅務機關退還多繳稅款，並加算銀行同期存款利息，稅務機關及時核實後應當立即退還。”