根據稅法實施條例規定，企業所得稅按年計算，分月或分季度預繳。按月(季)預繳(壹般為季度)，所得稅年終匯算清繳的會計處理如下。
1，月或季應納所得稅:
借方:所得稅
貸:應交稅費-應交企業所得稅
2.繳納季度所得稅時:
借:應交稅費-應交企業所得稅
貸款:銀行存款
在除夕4月30日前進行匯算清繳的，從預繳稅額中扣除全年應納所得稅額，正數為補稅額:
借方:以前年度損益調整
貸:應交稅費-應交企業所得稅
所得稅應註意的事項
企業合理的工資薪金應據實扣除，這意味著取消了已實施多年的內資企業計稅工資制，切實減輕內資企業負擔。但是，允許據實扣除的工資、薪金，必須是“合理的”，明顯不合理的工資、薪金是不扣除的。
職工福利基金、工會經費和職工教育經費的比例分別為14%、2%和8%。但如果將“應納稅工資總額”調整為“工資薪金總額”，扣除額會相應增加。在職工教育經費方面，為鼓勵企業加強職工教育投入，實施條例規定，除國務院財政稅務主管部門另有規定外，企業發生的職工教育經費不超過工資薪金總額8%的部分，準予扣除；超出部分應允許結轉並在未來納稅年度扣除。