差異1：獲得知識和技能
獲得美國金融碩士學位的人通常關註金融的理論和技術方面。他們利用高等數學和統計學深入研究資產和負債在不同情況下如何分配的細節。
管理投資和處理公司財務都是這種高度數學化的財務方法的重要領域。通常情況下，獲得碩士學位的人會專註於分析和建立量化模型，以便管理人員用來做決策。
獲得美國會計碩士學位的人學習會計——“商業語言”。會計溝通組織在做什麽——從哪裏獲得資金，如何使用這些資金，以及經營成果是什麽。會計碩士的學生在財務方面有很強的基礎知識，以及會計相關的技能，如準備財務報表、處理稅務和進行審計。
學生也學習將數學應用到許多商業任務中，但他們專註於以聰明的方式使用數學，而不是應用深奧的公式或高級統計。MAC的學生還會接受範圍更廣的普通商業教育，以及專註於軟技能的課程，如寫作、公開演講和管理他人，這些都是商業成功的關鍵。
差異2：其他專業證書的許可
當然，碩士學位在résumé網站上看起來不錯，但有時它是獲得額外證書的敲門磚。
壹些獲得美國金融碩士學位的人可能會繼續獲得其他證書，比如許多投資經理都擁有的特許金融分析師(CFA)稱號。但許多領取碩士學位的人沒有額外的證書，也沒有這些證書帶來的更高的收入和額外的職業前景。
然而，會計碩士學位獲得者通常會成為註冊會計師。註冊會計師是壹個備受尊敬的機構，它允許其持有人監督某些稅務和審計職能。會計碩士課程是為成為註冊會計師而設計的，而金融碩士課程則不是。
會計碩士的接受者也可以根據特定的職業興趣獲得額外的證書，包括CFA。
再者，美國會計碩士與金融碩士對於先修課程差異不大，體現在各別先修課程差異：
金融碩士需要先修課程，包括以下幾門：微觀經濟學、宏觀經濟學、統計、概率、微積分、國際金融、金融學
會計碩士專業先修課程，包括微觀經濟學，統計學，金融，經濟學，財務會計，管理會計，中級會計I，中級會計II等。
最後，兩者錄取側重點不同，但是對於學術要求都高！
這兩個項目申請，都認可GRE或者GMAT成績；
會計碩士大部分需要會計學相關的商科背景，金融碩士需要體現強大的定量背景，所以側重點可能會不同；
實習項目的話，會計碩士不強制經驗，但是金融碩士基本都會強調，但是這兩者錄取新生都會具備半年以上的實習項目經驗；
對於學術背景GPA而言，GPA要求都不低於3.0；
專業背景而言，會計碩士會明確只接受會計背景，部分會接受無會計專業的申請者，金融碩士的話，呈現多元化背景，普遍包括經濟學、社會科學等。