資金從委托財產托管賬戶轉入投資資產托管賬戶，才算正式投資的開始。這是由委托財產托管賬戶和投資資產托管賬戶的功能不同決定的。委托財產托管賬戶作為“蓄水池”起著隔離和過渡的作用，有多種用途和功能，因此其存款余額會頻繁變化；如果將委托財產托管賬戶的這些功能交給投資資產托管賬戶，委托資產管理的金額會頻繁變動，必然會造成投資管理人疲於應付，投資收益率的評估計算和投資管理費的計算也會復雜很多。正是因為有了委托財產托管賬戶的存在，投資管理人面臨的環境才會相對簡單，從而可以全心投入投資。尤其是在壹個地方
當企業年金項目選擇多個投資管理人時，這個問題變得更加清晰:當資金還在委托財產托管賬戶時，沒有人知道每個投資管理人當時實際管理的確切金額，此時還沒有進行實際投資；只有當受托人向托管人發出投資分配指令，托管人將委托財產托管賬戶中的資金轉入相應投資管理人投資組合的投資資產托管賬戶時，才能表明資金已正式開始投資。
其次，要明確管理費是從哪個賬戶支付的。委托管理費、托管費、投資管理費無疑應該從企業年金資產中支付，但從哪個托管賬戶支付並不明確。筆者認為，從委托財產代管賬戶中支付是合適的。這是因為委托財產托管賬戶本身要承擔與投資清算沒有直接關系的各種職能；應盡量保證投資資產托管賬戶資金進出的穩定性，排除非投資因素的幹擾，讓投資管理人有壹個相對簡單的環境來專心投入投資工作，這也應該是追求企業年金資產保值增值的企業和員工的理性選擇。
第三，要註意投資資產的托管賬戶和
證券賬戶與結算備付金賬戶的區別。有人分不清三者的區別，甚至認為後兩者屬於不同類型的投資資產托管賬戶。其實區別很明顯。投資資產托管賬戶只是壹個銀行存款賬戶。證券賬戶由托管人根據受托人的授權，以企業年金基金的名義在中國證券登記結算公司上海、深圳分公司開立，用於企業年金的交易所證券投資；結算備付金賬戶由托管人以自己的名義在中國證券登記結算有限責任公司上海、深圳分公司開立，用於企業年金基金資產的資金結算和交收。