1、如果企業印花稅不通過“應交稅費”科目核算，會計分錄為：
借：稅金及附加——印花稅；
貸：銀行存款；
2、如果企業印花稅通過“應交稅費”科目核算，會計分錄為：
借：稅金及附加——印花稅；
貸：應交稅費——應交印花稅；
繳納時：
借：應交稅費——應交印花稅；
貸：銀行存款。
印花稅的計算：
1、納稅人根據應納稅憑證的性質，分別按比例稅率或按件定額計算應納稅額。應納稅額不足壹角的，免納印花稅。應納稅額在壹角以上，其稅額尾數不滿五分的不計，滿五分的按壹角計算繳納。財產租賃合同，稅額不足壹元的按壹元貼花；
2、凡修改合同增加金額的，應就增加部分補貼印花；
3、同壹憑證，因載有兩個或者兩個以上經濟事項而適用不同稅目稅率，如分別記載金額的，應分別計算應納稅額，相加後按合計稅額貼花，如未分別記載金額的，按稅率高的計稅貼花；
4、應納稅憑證所載金額為外國貨幣的，納稅人應按照憑證書立當日國家外匯管理局公布的外匯牌價折合人民幣，計算應納稅額。
綜上所述，國家稅收部門對印花稅的相關規定，在處理時要嚴格按照標準來進行納稅。
法律依據：
《中華人民***和國印花稅暫行條例》第三條
納稅人根據應納稅憑證的性質，分別按比例稅率或者按件定額計算應納稅額。具體稅率、稅額的確定，依照本條例所附《印花稅稅目稅率表》執行。應納稅額不足壹角的，免納印花稅。應納稅額在壹角以上的，其稅額尾數不滿五分的不計，滿五分的按壹角計算繳納。