2、學習時間不同。函授專升本必須要在3年的時間裏面完成學習，只可以長但不可以小於三年;但是自考則沒有相關的時間規定，只要考生能過就可以了。
3、費用不同。函授專升本和平常的全日制教育繳費模式差不多，都是按照年費收取的，而自考本科則是考壹科，收取壹科的費用。
4、學習方法不同。函授專升本多數以面授的形式出現，而且必須要學校組織學習和考試;但是自考的話是完全通過個人努力來完成學業的。
5、畢業形式不同。函授專升本畢業以後可以得到成人教育畢業證書，也可以直接申請學歷證書;而自考本科則需要在完成專業規定的課程後，方可遞交學歷證書的申請證明。
另外，在考試難度、社會認可度、證書方面也有壹定不同。
自考專升本實質就是自考本科，自考升本是各類專升本考試中是難度最大的，需要將十幾門課程全部通過才能拿到畢業證。特別是理科性專業，很多學生考了幾年都拿不到畢業證以致最後放棄。畢業證由省自考辦頒發，證書上會蓋省自考委員會和主考院校2個章。由於難度大，所以還是比較受企業的認可。拿到學士學位證需要3門學位課程平均70分上，單門不低於65分，且學位外語及格。
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