營改增後掛靠工程會計分錄的做法舉例說明如下：
向建設單位收取工程款時，借：銀行存款100萬元 貸：預收賬款100萬元；
向掛靠單位支付工程款時，借：預付賬款90萬元，貸：銀行存款90萬元；
按進度向掛靠單位收取管理費用2萬元，在記事簿中記載，不作賬務處理。
對於掛靠經營的會計處理分兩部分考慮：通常的掛靠形式按照被掛靠人的不同分為兩類，壹類是個人掛靠有資質的施工企業，另壹類是沒有資質的或者資質較低的企業掛靠有資質的企業的。
掛靠人壹般只繳管理費，其他的問題全部由掛靠人自己承擔(包含企業所得稅)，掛靠的收費方式有以下幾種：
按照合同價款提取百分點；
按合同價款提取百分點後，還要按照結算價高出合同價款的部分再提取壹個百分點；
按照掛靠壹次收取壹定的固定費用。