財務會計是針對企業內部的資金運動，而預算會計是針對政府的預算資金活動。財務會計的核算要素是資產、負債、所有者權益、收入、費用和利潤；預算會計是資產、負債、凈資產、收入和支出。
2、適用範圍不同
預算會計適用於各級政府財政部門、各級行政單位和各類事業單位，適用對象明顯是非盈利性的，故又稱非營利組織會計。企業會計適用於以營利為目的從事生產經營活動的各類企業。
3，主要目標不同。
財務會計的目標是通過對企業日常經營活動的核算和分析，使企業以最少的資金獲得最大的經濟效益。預算會計適用於政府部門、行政單位和事業單位，其目標是反映預算的收入和支出，而不是盈利。