(A)審計線索的變化
由於會計電算化，審計線索發生了很大的變化，傳統手工會計系統中的審計線索在電算化系統中會被中斷甚至消失。在手工系統中，從原始憑證到記賬憑證，從過賬到編制財務報表，每壹步都有文字記錄，有經手人簽字，審計痕跡非常清晰。審核員可以根據需要進行直接、反向或抽查。為了有效地對會計電算化人員進行審計，在設計和開發會計電算化系統時，必須註意審計需求，並留下新的審計線索。例如，妳應該留下每筆經濟交易的詳細記錄，而不僅僅是更新的當前余額。某些系統中的臨時文件會在壹段時間後被刪除。如果審計需要檢查這些文件，應將其復制以供參考。
(二)會計系統內部控制的變化
世界上的現代審計都是以制度為基礎的，即審計人員要對會計制度的內部控制進行審查和評價，以此作為制定審計計劃和確定抽查範圍的依據。由於會計系統是電算化的，手工會計系統原有的內容控制不能適應電子數據處理的新特點，不能有效降低電算化會計系統特有的風險。美國註冊會計師協會出版的《審計準則第3號簡介》指出:“如果客戶在其會計系統中使用電子數據處理，無論應用是簡單的還是復雜的，審計人員都應該充分了解整個系統，以便他能夠識別和評估該系統的基本會計控制的特征。在更復雜的電子數據處理應用的情況下，審計員將在實施必要的審計計劃中應用專門的電子數據處理專業知識。”在會計電算化條件下，由於內部控制的變化，審計人員必須學習電算化系統的內部控制，掌握其復核方法。對於程序控制，審核員應使用計算機輔助審核技術進行審核。對於電算化會計信息系統內部控制的薄弱環節，審計人員應當能夠評估其影響，並向被審計單位提出改進建議。
(三)審計內容的變化
在會計電算化條件下，雖然審計的監督職能沒有改變，但審計內容發生了變化。在電算化會計信息系統中，會計事項由計算機按照程序自動處理。如果系統的應用程序出現錯誤或被非法篡改，計算機只會按照給定的程序以同樣錯誤的方式處理所有相關的會計事項，而系統可能會在不被察覺的情況下被植入非法的詐騙程序，不法分子可以利用這些詐騙程序侵吞企業的大量財產。系統的處理是否合規、合法、安全、可靠，直接關系到計算機系統的處理和控制功能。電算化會計信息系統的特點及其固有的風險決定了審計內容應增加對計算機系統處理和控制功能的審查。在會計電算化條件下，審計人員應花更多的時間和精力去了解和審查計算機系統的功能，以確認其處理的合法性、正確性和完整性，確保系統的安全性和可靠性。
當壹個系統已經完成並投入使用時，對其進行改進比在系統設計和開發階段要困難和昂貴得多。因此，除了對投入使用後的電算化會計信息系統進行審計外，還應提倡審計人員在系統的設計開發階段參與事前和事後審計。
(D)對審計人員的要求更高。
在會計電算化條件下，由於審計線索內容控制、內容和審計技術的變化，對審計人員的要求較高。不懂計算機的審計人員不能因為審計線索的變化而審計；不了解會計電算化系統的特點和風險，不能識別和審查其內部控制；我不知道怎麽會有電腦，所以不會復習，也不會用來審計。因此，要求審計人員不僅要具備會計和審計理論與實務知識，還要具備計算機和會計電算化的知識和技能。