兩者區別如下：
壹、適用範圍不同
《小企業會計準則》適用於在中華人民***和國境內設立的不對外籌集資金、經營規模較小的企業（不包括以個人獨資及合夥形式設立的小企業）。符合《小企業會計準則》規定的小企業，按照制度規定可以選擇執行《企業會計準則》。若選擇執行了《企業會計準則》，就不能同時選擇執行《小企業會計準則》的有關規定。而《企業會計準則》的適用範圍，按照《企業會計準則》的規定，除不對外籌集資金、經營規模較小的企業，以及金融保險企業外，在中華人民***和國境內設立的企業（含公司），執行《企業會計制度》。從《小企業會計準則》的規定看，符合《小企業會計準則》規定的小企業也可執行《企業會計準則》。
二、會計科目設置不同
《小企業會計準則》比《企業會計準則》少設了25個壹級科目。原因主要有如下兩個方面：第壹，小企業經濟業務相對簡單，因此可將《企業會計準則》中的部分科目進行歸並，如應收股利和應收利息合為應收股息科目，原材料和包裝物歸並為材料科目等。第二，小企業會計核算簡化或者沒有某科目所要反映的經濟業務，從而可少設。如資產科目少設了自制半成品、分期收款發出商品、各項長期資產的減值準備、未確認融資費用和待處理財產損溢；負債科目少設了應付股利、預計負債、應付債券；所有者權益科目少設了已歸還投資；損益類科目少設了補貼收入、以前年度損益調整。
三、賬務處理不同
資產清查的處理不同。《小企業會計準則》中沒有設置“待處理財產損溢”科目，小企業在財產清查中發生資產的盤盈或盤虧時直接進行處理。筆者認為這種處理方法簡明扼要，與資產負債表中所反映的內容相符。而《企業會計準則》中的資產負債表中已取消了資產待處理項目，企業在編報前必須將待處理的資產進行處理，因此財產清查還要通過“待處理財產損溢”科目核算，筆者認為這是壹種多余。
2.不計提長期資產減值準備。長期資產的可收回金額較難確定，計提減值準備時需要進行較多的職業判斷，而小企業會計人員少，高素質的會計人員更少，所以《小企業會計準則》僅要求對短期投資、存貨和應收款項計提跌價或壞賬準備，不要求對固定資產、無形資產等長期資產計提減值準備。
3.簡化長期投資的核算。小企業投資的業務比較少，按重要性原則對長期股權投資采用簡化了的成本法或簡化的權益法核算。
按《小企業會計準則》中成本法的規定，股權持有期間內，企業應於被投資單位宣告發放現金股利或利潤時確認投資收益。按被投資單位宣告發放現金股利或利潤中屬於應由本企業享有的部分，借記“應收股息”科目，貸記“投資收益”科目。制度中不要求嚴格區分投資前被投資企業實現的利潤的分配還是投資後被投資企業實現的利潤的分配，但如果在投資當年取得被投資單位分派的屬於以前年度實現的利潤，則應沖減投資成本。《小企業會計準則》權益法簡
核算主要體現在如下兩個方面：
第壹，取得投資時不單獨核算股權投資差額。《小企業會計準則》權益法的規定，以現金取得長期股權投資時，按實際支付的全部價款（扣除已宣告但尚未領取的現金股利）入賬，不單獨核算股權投資差額，不對該差額進行攤銷。
第二，不對被投資單位除凈損益外的其他所有者權益變動進行處理。《小企業會計準則》中權益法規定：“采用權益法核算的小企業，長期股權投資的賬面余額應根據小企業享有被投資單位所有者權益份額的變動，對長期股權投資的賬面余額進行調整。”但在長期股權投資科目的具體解釋中只要求在被投資企業實現利潤或發生虧損時，小企業按應享有的份額或應分擔的份額增加或減少長期股權投資，同時增加或減少投資收益，而沒有規定對被投資單位除凈損益外的其他所有者權益變動進行處理。由於《小企業會計準則》的長期股權投資科目沒有設三級科目，也無法反映是否要對被投資單位除凈損益外的其他所有者權益變動進行處理。筆者的理解是為了簡化核算，不對其進行處理。
4.簡化了專門借款費用的核算。《小企業會計準則》對於借款費用的核算，要求企業在固定資產開始建造至達到預計可使用狀態之前發生的專門借款費用，均可資本化計入固定資產成本，而不必與資產支出數掛鉤。這簡化了借款費用資本化的計算手續，但可能會導致資本化金額誇大，進而多計固定資產價值，少計本期利潤，但長遠看又會使未來時期的折舊費用予以抵銷
5. 簡化了融資租賃固定資產的計量。《小企業會計準則》規定，融資租入固定資產以合同或協議約定應支付的價款和使固定資產達到預定可使用狀態前發生的其他有關必要支出，作為其入賬價值，這避免了計算最低租賃付款額過程中涉及的職業判斷及對未來現金流量折現等較為繁瑣的計算。
6. 簡化了所得稅的賬務處理。《小企業會計準則》規定，小企業計算出當期應交的所得稅，借記“所得稅”科目，貸記“應交稅金——應交所得稅”科目。可見，所得稅的賬務處理采用了本期所得稅費用按照本期應稅所得與適用的所得稅稅率計算的應付稅款法，即本期所得稅費用等於本期應交的所得稅費用，時間性差異影響所得稅的金額均在本期確認所得稅費用或在本期抵減所得稅費用，而不作為資產負債表中的壹項負債或壹項資產加以反映。這簡化了時間性差異的核算。
7. 其他資產核算方法的簡化。《小企業會計準則》還簡化了壹些資產的轉移價值核算方法。如低值易耗品的價值攤銷要求采用壹次攤銷或分次攤銷法，沒有要求按五五攤銷法；短期投資期末按總成本與總市價孰低計量，不需要分項比較計量，在短期投資轉讓時可不結轉其已提的跌價準備。
8. 待轉資產價值核算不同。《企業會計準則》中的待轉資產價值科目核算內容是外商投資企業待轉的接受非現金資產捐贈的價值。外商投資企業接受非現金資產捐贈時，按確定的實際成本，借記非現金資產類科目，貸記“待轉資產價值”科目；年終企業按“待轉資產價值”科目的賬面余額，借記“待轉資產價值”科目，貸記 “應交稅金——應交所得稅”科目和“資本公積——其他資本公積”。財政部在《關於執行〈企業會計準則〉及相關會計準則問題解答（三）》中將“待轉資產價值”科目的運用擴展為執行《企業會計準則》的所有企業。
而《小企業會計準則》中的待轉資產價值科目核算內容是小企業接受捐贈待轉的資產價值，其核算內容不僅包括了小企業接受的非現金資產捐贈，還包括了接受現金資產的捐贈。其賬務處理為：小企業接受貨幣性資產捐贈時，借記“現金”或“銀行存款”科目，貸記“待轉資產價值”；接受非現金資產捐贈時，按確定的實際成本，借記非現金資產類科目，貸記“待轉資產價值”科目；期末如果接受捐贈待轉的資產價值全部計入當期應納稅所得額，按“待轉資產價值”科目的賬面余額，借記“待轉資產價值”科目，貸記“應交稅金——應交所得稅”科目和“資本公積”，期末如果接受捐贈的非現金資產金額較大，經批準可以在規定期限內分期平均計入各年度應納所得額，分期進行上述轉賬處理。這使小企業的“待轉資產價值”科目核算內容更全面，核算也更趨於合理。增加了以應收債權融資或出售應收債權的會計處理。根據財政部2003年5月15日發布的關於企業與銀行等金融機構之間從事應收債權融資等有關業務會計處理的暫行規定，《小企業會計準則》及時地增加了以應收債權融資或出售應收債權的會計處理，用以規範企業與銀行等金融機構之間從事的融資業務的會計核算。
四、財務報告方面的不同
《小企業會計準則》只要求小企業提供資產負債表和利潤表兩張基本報表，而且報表的內容比較簡單。如根據小企業業務比較簡單，有些業務發生的可能性很少的情況，刪除了若幹項目。象資產負債表中資產項目中減少了預付賬款、應收補貼款、遞延稅款借項等項目，負債中減少了預收賬款、應付股利、專項應付款、遞延稅款貸項等項目，所有者權益中減少了已歸還投資項目。利潤表中減少了補貼收入項目等。