企業發放員工薪資時的扣款應該將扣款金額計入“其他應收款”科目裏面核算，發放工資時，其會計分錄為：
借：應付職工薪酬—工資，
貸：庫存現金/銀行存款(實發工資數)，
其他應付款—養老保險/醫療保險等(個人支付部分)，
其他應付款—住房公積金(個人支付部分)，
應交稅費—應交個人所得稅(代扣代繳個稅)，
其他應收款(其他應扣款)。