不同的培訓目標
碩士是培養科研人才，以大學教師和科研機構研究人員為專業目標，以理論教育為主。學生畢業後可以獲得學歷和學位證書，社會認可度比較高。與碩士相比，學術型研究生理論知識充足，但缺乏實踐和應用能力，動手能力相對較弱。
專業側重於理論研究和實際應用，最突出的特點是學術性和專業性相結合。主要培養在某壹職業或某壹行業領域具有紮實的專業理論基礎，具有解決問題的實踐能力，具有敬業精神的高級應用型人才。壹般碩士學歷的人往往從事工程師、會計、律師等實踐導向的工作。
2.不同的栽培方法
碩士以基礎理論學習為主，學制3年。專業碩士面向實際應用，以職業需求為目標。教學內容強調理論與應用的有機結合。此外，專業註重案例分析和實踐研究，註重培養學生研究實際問題的意識和能力。學習過程中至少有半年的實踐環節，學制2年。
3.不同的招聘條件
除了工商管理等專業，大部分畢業生對報考人員沒有工作經驗要求，也就是說應屆畢業生和往屆畢業生都可以報考。但有些專業，如管理碩士(MPA)，要求考生有相關工作經驗。另外，對於跨專業的，醫學專業無論是碩士還是碩士壹般都不允許。
4.學費差異
壹般來說，碩士學費壹年8000-10000元。專碩學費比較高，壹般8000-1.5萬元。但是碩士基本是三年，碩士只有兩年。所以學費總額相差不大。最重要的是，碩士提前壹年畢業，這樣不僅沒少花錢，還早早開始賺錢。兩者的時間和機會成本差異還是比較大的。
5、難易程度不同
這壹點最明顯的體現就是英語壹和英語二的區別。僅僅從考試大綱來看，英語壹比英語二多了幾個考點。總的來說，前者自然比後者更難。所以有些高校尤其是名校不考英語二而是考英語壹..對英語的要求相當高。
另外，數學三與管理聯考數學部分整體難度差異較大。我們以會計專業為例。會計碩士很難考數學三，數學三包括高等數學，線生成，概率論。會計專業管理聯考數學部分都是初高中數學知識，比較簡單。