首先，常見問題:
1，R&D費用數據核算不清，歸集方式不統壹，否則輔助賬不全、不規範或根本沒有輔助賬；
2.高新技術企業在申請復審時提交的在中國境內發生的R&D費用總額占R&D費用總額的比例不超過60%；
3.不合理收取R&D費用。比如某企業R&D人員的平均年薪遠低於普通人員，直接投入費用占R&D總費用的比重過高，不同R&D項目的支出金額和結構完全壹樣。
4.委托外部R&D產生的80%的R&D費用不計入R&D費用。
5.高新技術企業提交申請和評審的其他費用占20%以上。
6.該企業的R&D項目包含產學研合作項目，但該類支出在R&D結構附表中沒有體現，導致委托外部研發支出與附件材料產學研合作協議不壹致。
7.許多企業在申請高新技術企業復審時提交相同的R&D項目報告，R&D費用清單和R&D項目(RD)表中描述的數據不匹配。
二、如何解決:
1.在高新技術企業申請復檢前，公司需要建立R&D費用的核算體系，在壹級會計科目中設置“R&D費用”，然後按照R&D項目匯總二級會計科目下的八大類費用，最好是三級會計科目，這樣整體的R&D費用清單就出來了，匯總不會混亂，同時核對時也不會因為數據混亂而出現錯誤。
2.收集時註意各項指標的標準。