為了保護企業存貨的安全完整，做到賬實相符，企業應對存貨進行定期的清查。企業發生的存貨毀損，應當將處置收入扣除賬面價值和相關稅費後的金額計人當期損益。存貨的賬面價值是存貨成本扣減累計跌價準備後的金額。存貨盤虧造成的損失，應當計入當期損益。
存貨清查通常采用實地盤點的方法。即通過盤點確定各種存貨的實際庫存數，並與賬面結存數相核對。對於賬實不符的存貨，核實盤盈、盤虧和毀損的數量，應在期末前查明造成盤虧或毀損的原因，並據以編制“存貨盤點報告表”，根據企業的管理權限，經股東大會或董事會，或經理(廠長)會議或類似機構批準後，在期末結賬前處理完畢。盤盈的存貨，應沖減當期的管理費用；盤虧的存貨，在減去過失人或者保險公司等賠償和殘值之後，計入當期管理費用，屬於非常損失的，計入營業外支出。在報經有關部門處理前，根據“存貨盤點報告表”，將盤盈或盤虧、毀損的存貨，先作為待處理財產溢余或損失處理，同時按盤盈或盤虧、毀損存貨的實際成本調整存貨的賬面價值，使存貨賬實相符。
二、存貨清查的核算
為了核算企業在財產清查中查明的各財產物資的盤盈、盤虧和毀損，企業應設置“待處理財產損益”賬戶。從其性質和結構看，該賬戶具有雙重性質。其借方登記發生的各種財產物資的盤虧金額和批準轉銷的盤盈金額，貸方登記發生的各種財產物資的盤盈金額和批準轉銷的盤虧金額。期末借方余額為尚未處理的各種財產物資的凈損失；期末貸方余額為尚未處理的各種財產物資的凈溢余。
(壹)存貨盤盈的核算
由於盤盈的存貨沒有賬面記錄，因此產生了盤盈應該予以補記，按照存貨的計劃成本或估計價值，借記有關存貨賬戶，貸記“待處理財產損益”賬戶；存貨盤盈壹般是由於收發計量或核算上的差錯所造成的，故應相應的沖減管理費用，借記“待處理財產損益”，貸記“管理費用”賬戶。在計劃成本進行存貨日常核算的情況下，盤盈存貨按計劃成本入賬。
例1某企業進行存貨清查時，發現某產品盤盈100公斤，計劃單位成本為9．5元，計950元。應作如下會計分錄：
借：庫存商品950
貸：待處理財產損益950
經查該項盤盈屬於收發計量錯誤造成，經批準作為沖減費用處理。應作如下會計分錄：
借：待處理財產損益950
貸：管理費用950
(二)存貨盤虧和毀損的核算
存貨的盤虧和毀損，先按其賬面成本，借記“待處理財產損益”賬戶，貸記有關存貨賬戶。經審批後，按發生的原因和相應的處理決定，分別進行轉銷。
屬於自然損耗造成的定額內損耗，應借記“管理費用”賬戶；屬於過失人責任造成的損失，應扣除其殘料價值，借記原材料”、“其他應收款”賬戶；應向保險公司收取賠償金，借記其他應收款——保險公司”賬戶；剩余凈損失或未參加保險部分的損失，借記“營業外支出——非常損失”賬戶；若損失中有壹般經營損失部分，借記“管理費用”賬戶。按盤虧和毀損數額，貸記“待處理財產損益”賬戶。
例2某企業進行存貨清查時，發現材料短缺5000公斤，其計劃單位成本為3．6元，計18000元，材料成本差異率為+2％。應作如下會計分錄：
借：待處理財產損益18360
貸：原材料18000
材料成本差異——原材料360
經查，該項短缺分別有多種原因造成，經批準，分別進行轉銷。
借：原材料
其他應收款——保險公司
營業外支出——非常損失
貸：待處理財產損益