壹般來說，征地補償計入成本，樹木青苗補償計入管理費用。根據企業的性質，包含的成本項目會有所不同。
壹般來說，拆遷補償款和青苗補償款都可以用收據或者白條記錄。但是青苗和拆遷補償金額大，政策性強，所以。應有國土、房屋拆遷等監管單位的認證材料。
從稅前扣除的角度來看，青苗補償費稅前扣除目前在相應文件中並不明確，各地執行情況不壹。有些地區只要取得村委會出具的印有財務監督印章的合法收據，就可以在企業所得稅前入賬和抵扣。
部分地區可憑村委會出具的加蓋財務監督印章的合法收據和雙方簽訂的補償協議，在企業所得稅前入賬並扣除。有的地區要求在企業所得稅前抵扣發票，有的地方稅務機關可以開具青苗補償費發票。建議聯系當地主管稅務機關確認。
《國家稅務總局關於印發〈企業所得稅稅前扣除辦法〉的通知》(國稅發[2000]084號)規定，納稅人申報扣除應當真實合法。真實是指能夠提供適當的證據證明相關費用實際發生；合法性是指符合國家稅收法規。其他規定與稅收法規不壹致的，以稅收法規為準。
百度百科-企業所得稅稅前扣除方法