唐開元、大歷年間，先賢法藏的創始人傳弟子法界大師鐘天柱精通華嚴，言之鑿鑿。他的弟子程觀說，中唐以後推崇華嚴，尊華嚴而輕大師，並賜他涼師稱號，對中國佛教產生了深遠的影響。
宋太平興國元年(公元976年)，吳越王千洪初賜“天生寺”，寺內莊嚴肅穆，信眾眾多。清朝時，雲門僧人宋祁來到杭州方丈中天竺寺。宋祁因其保護法律的著作而深受朝野尊敬，宋仁宗的趙真被稱為“祆教大師”。於是，中天竺寺在朝野聲名鵲起，並趨於興盛。鄭和四年(公元1114)，宋徽宗為了祈求宋朝的永遠保護，將中天竺改名為“天寧萬壽永祚寺”。
宋朝南遷，開封和尚幼堂隨帝室南遷。中天竺寺住持以講經、弘法聞名。南宋“尊五嶽，評江南名剎”，評“五嶽十寺”時，中天竺在佛寺十寺中排名第壹。元、天朝時，土帖木兒召見大新法師，授予“廣智法師”稱號，並將中柱寺改為“田麗永佐寺”。他的弟子宗靈、辛建等。都是博覽群書的著名僧人。明朝洪武初，重建中天竺，命名為“中天竺廟”。當時著名的高僧嵇曇住在Xi，他在禪的時候，聖賢雲集，群英薈萃。明太祖喜歡稱他為“學者”和“男人”。清初，康熙曾赴中天竺題寫“朱零次元”匾額。李鴻南巡時，為中天竺玉天寺額，改名“法凈寺”。時過境遷，舊的觀念很難復活。民國以來，乃至“文革”，金像倒下，寺廟被毀，寮民易手，和尚被趕走。
十壹屆三中全會後，宗教政策付諸實施。1986年，中天竺也被杭州市佛教協會收回重建。現在，天王殿和大雄寶殿已經修復，童淵殿和蓮池海輝樓也已重建，在伽藍已有千年歷史，重現昔日景觀。重建後的童淵大廳非常壯觀，高23米，平面呈方形，琉璃瓦。壹個12米高的悲觀主義圖標被供奉在童淵大廳。菩薩的形象美麗端莊。她以親切、慈悲、關懷的目光俯視人，這種目光微妙而優雅，激發出壹種巨大的智慧力量，足以摧毀壹切外在和內在的煩惱和障礙，使眾生從愚昧中解脫出來。這個偉大的悲觀聖像有十壹張臉，四十八只手臂，除了慈悲，還有憤怒，充分體現了觀音菩薩不可思議的力量。或轉宮手，或轉佛手，或數佛珠，或聚寶盆手，或露珠手，或...慈悲願成就眾生，遠離邪魔，速證菩提。
1993年底，杭州市佛教協會會長俞雲熙在中天竺法凈寺創辦了佛學學術研討會，並於1998年創辦了杭州佛學院，開創了杭州佛學教育的新局面。法凈寺總體規劃已經完成。很快，壹座千年古剎，繁華梵宮，巍峨金像，護佑龍天，太陽高掛，獅子報聲，三寶如雲！