采用雙功能、雙基礎、雙報告。
1.“雙功能”：政府會計由預算會計和財務會計構成。
2.“雙基礎”：預算會計實行收付實現制，國務院另有規定的，從其規定;財務會計實行權責發生制。
3.“雙報告”：政府會計主體應當編制決算報告和財務報告。
政府會計制度改革最大的創新是建立預算會計和財務會計適度分離又相互銜接的政府會計核算模式。該制度具有預算會計和財務會計“雙功能”核算體系， 分別采用收付實現制和權責發生制“雙基礎”核算模式，生成“雙報告”——決算報告和財務報告，既能反映政府會計主體的預算執行信息，又能反映其整體財務狀況、運行情況和現金流量信息。
“雙功能”即新制度下政府會計主體的會計核算具備財務會計與預算會計的雙重功能。新制度設置了相對獨立的財務會計與預算會計的會計科目體系，其中財務會計總賬科目 77 個，預算會計總賬科目 26 個。通過“5+ 3”的會計要素進行核算，財務會計核算政府會計主體的資產、負債、收入、費用、凈資產，會計記賬遵循“資產- 負債 = 凈資產”的會計等式。
預算會計核算政府會計主體的預算收入、預算支出和預算結余，會計記賬遵循“預算收入- 預算支出 = 預算結余”的會計等式。