京都大學現***有10個學部，各學部所屬系科及附屬設施有文學部，含文學、史學、哲學及人際學4系，***51個講座
學部設置
京都大學現***有10個學部，各學部所屬系科及附屬設施有文學部，含文學、史學、哲學及人際學4系，***51個講座，並設有文學博物館、中亞研究所等；
教育學部，含教育學、社會學、心理學3系***14個講座；
法學部，僅有法律學壹個系含公法、民刑法、基礎法學及政治學4科***39個講座，附屬圖書館中設國際政治法律文獻中心；
經濟學部，含經濟學、經營學2系***11個講座；
理學部，為京都大學最大的學部之壹，幾乎包括自然科學各個領域，即有數、理、化、生、宇宙、地球科學等9個系***70個講座，各系既相互獨立又相互交叉，設施有兩個天文臺，8個火山、地震、氣候、天體學等方面的觀測所，4個海洋實驗所，壹個植物園等；
醫學部，含有基礎和臨床兩大分部的若幹系科***有39個講座，附屬機構有校醫院，腦神經研究、免疫學研究設施，人體先天異常標本中心，綜合解剖中心，動物實驗設施等。
工學部，是京都大學最龐大的學部，含24個系168個講座，研究領域涉及冶金、電氣、自動化、航空、機械、原子能、土木建築、化工、交通、信息工程等，附屬機構有離子工程，自動化研究所、環境微量汙染防治、重質炭資源轉換等工程研究設施；
藥學部，含藥學、制藥化學兩系***13個講座，附設藥用植物園；
農學部，含10個系53個講座，並有附屬農場、林場、牧場、及供農學研究、亞熱帶作物、水產、細胞培養、農業會計等方面進行研究的設施等。 學部設置 學系綜合人知學部 人類科學系、國際文明學系、文化環境學系、認知情報學系、自然科學系 文學部 人文學科 經濟學部 經濟學、經營學 藥學部藥學系、制藥化學系法學部 基礎法學系，公法學系，民刑事法學系，政治學學系教育學部 教育學、社會學、心理學工學部地球工學科，建築學科，物理工學科，電氣電子工學科，信息學科，工業化學科含24個系理學部數、理、化、生、宇宙、地球科學等9個系農學部含10個系醫學部基礎醫學系、臨床醫學系研究生院設置
研究生院設有文學、教育學、法學、經濟學、理學、醫學、工學、農學、信息學等14個研究科，包含83個研究方向。研究生教育與學部教育結合在壹起，這樣可以充分利用人力、圖書館情報資料、儀器設備等資源，學部、研究生院各科、研究所三位壹體，對出成果和人才培養均有利。 研究學科專業名稱文學研究科文獻文化學，思想文化學，歷史文化學，行動文化學，現代文化學教育學研究科教育科學，臨床教育學法學研究科基礎法學，公法，民刑事法，政治學經濟研究科經濟系統分析，經濟動態分析，組織經營分析，現代經濟學理學研究科數學及數理解析，物理學及宇宙物理學，地球行星科學，化學，生物科學醫學研究科醫學，社會健康醫學系，人體健康科學系，社會健康醫學系藥學研究科藥科學，醫藥創成信息科學亞非地域研究研究科東南亞地域研究，非洲地域研究，全球地域研究信息學研究科智能信息學，社會信息學，復雜系科學，數理工學，系統科學，通信信息系統生命科學研究科綜合生命科學，高等生命科學地球環境學堂地球環境學，環境管理經營管理大學院（MBA） 工學研究科土木工學，土木系統工學，資源工學，環境工學，環境地球工學，建築學，生活空間學，機械 工學，機械物理工學，精密工學，原子核工學，材料工學，航空宇宙工學，電氣工學，電子物 性工學，材料化學，物質能量化學，分子工學，高分子化學，合成?生物化學，化學工學農學研究科農學，森林科學，應用生命科學，應用生物科學，，地域環境科學，生物資源經濟學，食品生 物科學 據1990年5月統計，京都大學的在校生中，本科生13,056人，其中女生1,629人；研究生中，讀博士課程1,799人，碩士課程2,283人；另外還有附屬電子醫學技術短期大學學生562人。
到1987年5月止，京都大學授予各種類型的博士學位19,663人。同期，全校***有教職員工5,433人，包括校長1人，職員2,833人,教授700人，副教授678人，講師152人，助教1,059人。京都大學是壹所國立大學，基本上由國家撥款，辦學經費充足，自創收入亦很可觀。在1989-1990年度，***支出798多億日元，其中用於人員支出近419多億日元，用於設備材料等支出近380億日元。學校各項收入來源有：大學醫院服務146億元；學生學費收入56億多日元；其他收入33億日元。另外還有科學研究補助費43億多日元。
到1987年5月止，全校***有教職員工5,433人 教員人員人數（人）校長1教授700副教授678講師152助教109 培養獨立自主精神
京都大學自古以來就有獨立自主辦學的優良傳統，建校初始，當時的文部大臣和京都大學的首任校長木下廣次就強調京都大學壹定要辦出自己的特色。要“比東大更尊重學生的獨立自主精神”。
1913年，抗議校長獨斷專行的“柳澤事件”，導致了校長選舉制度的產生。
1928年，法學部瀧川教授被解雇引起全校沸騰，抗議軍國主義踐踏民主和對愛國教師的迫害。
為了探求真理就要爭取自由研究的權利，同樣也只有有了這種權利才能保證自由學風的實行。有的京大學生說：“在這裏學習有種自由感，校方在學習和生活上從不施加過多的壓力，有誌者致學，無誌者盡興，各聽其便，互不幹擾。”因此，日本國內就有壹種流行的說法：“想讀書就去京大。”這種學風體現在教學上就是彈性的管理原則，全校實行選課制，這個制度是法學部在20年前創設的。據此學生可以打破學年的界限，只要取得規定的學分就可以畢業，且取得學分不壹定要經過考試，撰寫論文報告亦可取得學分。以理學部為例，在兩年的專業課程的學習中，由學生自己選擇最適合的專業基礎課程組合學習，然後再確定重點專業方向。專業基礎課程組合分為數學類、物理類、化學類、生物類四大塊，由學生任選壹塊。兩年專業課程組合分下列四種類型搭配：自然科學展望、***同基礎學科、專業基礎、專業課。對外來的留學生、本科生實行自由轉學和互換學分的制度。
培養具有獨立思考和判斷能力的人
自由的學習氣氛和嚴謹的學風並不矛盾，學校始終認為：學習是自願自覺的行動，要靠自己的責任感和不懈的努力，京大的特色就是要培養具有獨立思考和判斷能力的人。因而在這種學術氛圍裏用不著擔心這種“過分”的彈性會導致放任自流。事實上，在京大要想拿到學位要比其他學校（包括東大）困難得多。
同時，京都大學位於日本歷代的古都，有著悠久的日本傳統歷史和文化；遠離首都的政治中心和繁華的大城市，為學者準備了潛心治學的理想場所；優美的校園自然環境；京都人那種“優哉遊哉”的生活方式，這些獨特的學術環境與京都大學成果累累、人才薈萃都是分不開的。 研究
1.京都大學以自由自主的研究為基礎，通過高理論性的研究活動，為世界創造更多先進知識。
2.京都大學作為壹所綜合性大學，實現了基礎研究、應用研究、文科系以及理科系的研究等多樣全面發展。
教育
3.京都大學作為擁有多樣性以及和諧性的教育體系，在註重交流的前提下實現自主學習，使學生在習得卓越知識的同時能夠擁有創造性精神。
4.京都大學通過素質教育培養學生的豐富人性以及責任感，為地球以及社會的和諧***存做出貢獻。培養更多優秀學者以及擁有專業知識的人才。
與社會間的關系
5.京都大學作為壹所開放大學，在與地方社會進行密切合作發展的同時，著力於將知識應用以及傳播到社會中。
6. 京都大學作為壹所面向全球的大學，不斷加深與國際的交流，立誌為地球以及社會的和諧發展做出貢獻。
學校運營
7.京都大學為了促進學術自由發展，將會進壹步重視教育研究組織的自治性，實現全校的和諧***榮。
8.京都大學在推行重視環境、尊重人權的運營方式的同時，將會履行對社會的說明職責。 CWUR 2015世界大學排行榜：世界第17位，亞洲第二
QS世界大學排名（2014/15）：世界第36位，亞洲第五
QS世界大學排名（2015/16）：日本第壹（超越東京大學）
韋伯麥特裏克斯 日本大學排名：第2
2014世界大學聲譽100強排名：第19
QS 2010世界大學排名2010（綜合）：第25
QS 2010世界大學排名 2010（工學）：第17
QS 2010世界大學排名 2010（理學）：第13
《美國新聞與世界報道》(U.S.News & World Report)2010年世界大學排名（綜合）：第25（日本第2)
《美國新聞與世界報道》(U.S.News & World Report)2010年世界大學排名（人文）：第20
《美國新聞與世界報道》(U.S.News & World Report)2010年世界大學排名（工學與IT類）：第16
《美國新聞與世界報道》(U.S.News & World Report)2010年世界大學排名（生物科學和生命醫學）：第13
《美國新聞與世界報道》(U.S.News & World Report)2010年世界大學排名（自然和物理科學）：第10
《美國新聞與世界報道》(U.S.News & World Report)2010年世界大學排名（社會科學）：第29
美國《新聞周刊》世界100強大學排名 第29位
上海交大2013年世界大學學術排名：第26位
4片棕櫚葉2013全球頂級商學院排名：第31位
世界大學排行榜 2004年 2005年 2006年 2007年 2008年2009年2010年2011年2012年2013年2014年世界排位29312925252557 52 54 52 59 亞洲排名 44 532385779國內排名 222222222222015世界大學排行榜 世界排位39 亞洲排位5 國內排名1