1，概念不同
母公司是指總部設在母國，並通過在國際業務中的外國直接投資有效控制海外經濟實體的總公司。跨國公司的母公司大部分是由壹個國家的資本設立的，但在少數情況下，也可能由兩個或兩個以上國家的資本共同設立。
母公司作為整個跨國公司的決策中心，是在母國政府機構註冊的法人組織，負責組織和管理跨國公司在國內外的壹切生產經營活動。
在國際商務中，子公司是指由母公司投資全部或部分股份，依法設立的東道國法人企業。子公司在法律上獨立於母公司，具有獨立完整的公司管理組織體系，因此在經營上具有較大的獨立性和壹定的靈活性。
2.不同的獨立性
子公司雖然處於母公司的實際控制之下，在很多方面受到母公司的制約和管理，但在法律上是獨立的法人，以自己的名義從事經營活動，獨立承擔民事責任。子公司有自己的章程、董事會等企業決策機構。子公司擁有獨立的財產和資產負債表。
子公司和母公司以各自所有的財產為限各自承擔責任，互不關聯。母公司作為子公司的第壹大股東，只對子公司承擔其出資額的債務責任。設立子公司必須嚴格按照設立公司的要求提出申請，取得營業執照並依法辦理相關手續後方可開展業務。
3.不同的地位
公司根據其在控制與被控制關系中的不同地位，可以分為母公司和子公司。實際控制其他公司的公司是母公司，被其他公司實際控制的公司是子公司。
母公司對子公司的重大事項擁有實際決策權，可以決定子公司董事會的組成，可以直接行使任命董事會董事的權力。子公司的經營活動也應受母公司控制，服從母公司整體戰略和利益的需要。但這種控制是間接的，與母公司擁有的股權比例正相關。