財務管理人員在行政事業單位成本核算工作中起著重要的作用，是不可或缺的壹部分。他們的專業水平和專業技能對行政事業單位的管理有直接影響。因此，行政事業單位應盡快重視自身財務管理人員的成本核算工作，強化維護會計工作的意識。為了更好地在行政事業單位開展成本核算，促進成本核算的發展，應定期對財務管理人員進行培訓，提高其意識、業務水平和財務管理技能，全面強化其業務知識體系，更新其專業知識，增強其崗位責任感和道德感。此外，為了更好地提高財務管理人員進行成本核算的積極性和主動性，應在單位內部的考核體系中加入日常工作的績效考核，以更好地促進行政事業單位內部管理的良好發展。
(二)做好成本核算的基礎工作
行政事業單位要想管理好本單位的成本核算，就要建立健全本單位的全員管理制度，做到以下幾點:嚴格控制單位的各項費用支出，制定各項費用支出、資金使用、設備使用的定額，登記超支原因，分析原因，盡可能減少不必要的支出，最大限度地利用成本。財產物資管理要細化完善，所有財產物資都要登記，所有原始記錄都要建立健全，確保固定資產登記工作落實到位。通過建立固定資產卡片和臺賬，嚴格管理財產物資，明確所有財產物資的去向。
(三)改革會計評價和會計指標體系
目前，在行政事業單位的成本核算中，反映所有者權益的會計科目逐漸取代了只反映資金來源、弱化資金所有權的資金科目。行政事業單位正在建立以利潤為基礎的績效考核體系。由於企業經營發展，行政事業單位會計納入企業財務範圍。和企業壹樣，真正計算盈虧，走向多元化投資主體，呈現企業化趨勢。在深入改革之前，雖然行政事業單位的資金來源仍然是財政撥款，但行政事業單位的會計報表將從主要反映政府權益向強化自身財務責任轉變。
(四)完善固定資產核算。
固定資產核算方法的調整是最重要的。根據我國法律規定，行政事業單位采購固定資產應增設兩個會計科目:固定資產和固定資金。同時，將單位購置的固定資產全額詳細記入業務支出科目。行政事業單位應借鑒企業固定資產會計制度的成功經驗，防止業務支出的不均衡和無法保證業務支出的真實性和可比性。固定基金的調整通過提取折舊實現，會計分錄改為“借記-固定基金”提取固定資產折舊，貸記-累計折舊。這樣做可以更直觀地顯示固定資產的原始凈值，可以避免凈資產虛增的問題。