1、部分會計科目不同。
如工業會計使用的科目而商業會計沒有的科目：產成品、生產成本、制造費用、輔助生產、半成品等科目；
2、成本核算方法不同。
工業企業註重的是生產過程，也即是生產成本的控制核算；而對於商業企業主要是流通環節，主要針對入庫、出庫、期末進銷差價的核算問題。