付款申請單和費用報銷單的區別是：
1. 用途不同
付款申請單壹般用於采購付款，票到掛賬，付款沖賬。費用報銷單壹般用於直接費用的報銷，差旅費、招待費，辦公用品費等。
2. 發生的時間不同
付款申請單使用於業務發生前付款，如預付的貨款等，多數銀行轉賬到對方賬戶；報銷單用於業務發生後付款，如交通費、通訊費等，多數員工已墊付或之前有借款，業務結束後向財務報銷。
3. 性質不同
付款申請單，從嚴格意義上來說，就是單位主管會計和領導的“支付款項審批單”，要作為附件和實際付款的相關單據壹起入賬的；費用報銷單必須要有相關人員簽字才可以支付的，是登記憑證的“自制原始憑證”。
以上內容參考百度百科-付款申請單
以上內容參考中國會計網-費用報銷單與付款申請單的區別？