根據《財政國庫管理制度改革試點會計核算財政補充暫行辦法》的規定，行政、事業單位會計核算應在資產類別中增設“零余額賬戶資金使用金額”總賬科目。單位零余額賬戶的金額與人民幣存款具有相同的支付結算功能。
零余額賬戶資金使用金額的主要會計處理如下:
(壹)財政授權支付方式下，收到代理銀行蓋章的“授權支付到賬通知”時，根據通知所列金額，借記本科目，貸記“財政補貼收入”科目。
(二)按規定的額度，借記有關科目，貸記本科目。
(三)從零余額賬戶提取現金時，借記“庫存現金”科目，貸記本科目。
(4)因購貨退回國庫授權支付款項的，按照退回的金額，借記以前年度支付的款項，貸記“財政補貼結轉”、“財政補貼結余”、“存貨”等相關科目；本年支付的款項，應按歸還的金額，借記本科目，貸記“業務費用”、“存貨”等相關科目。
(5)年末根據代理行提供的對賬單，對取消金額進行相關賬務處理，借記“財政應退金額——財政授權支付”科目，貸記本科目。
事業單位本年度財政授權支付預算指標數大於零余額賬戶用款數的，按照未用款數，借記“財政返還金額——財政授權支付”科目，貸記“財政補助收入”科目。
擴展數據零余額賬戶的性質決定了其在國庫單壹賬戶體系和財政支付管理中的重要地位，是實現財政集中支付的橋梁。首先，零余額賬戶是單壹國庫賬戶與貨物或服務提供者賬戶之間的紐帶，代理單壹國庫賬戶對貨物或服務提供者的支付。
財政支付的本質是將預算資金從國庫單壹賬戶轉移到商品或服務提供者賬戶。在零余額賬戶模式下，這種資金轉移是通過零余額賬戶的支付和清算活動實現的。預算支出先從零余額賬戶支付到貨物或服務提供者賬戶，再從國庫單壹賬戶支付清算到零余額賬戶，完成整個支付過程。
其次，更重要的是，零余額賬戶是控制預算資金最終支付的必要技術手段，是我國單壹國庫賬戶制度的重要制度安排，確保預算資金只有在實際支付時才會流出單壹國庫賬戶。
零余額賬戶的零余額特性使所有預算資金集中控制在單壹國庫賬戶，從而克服了因賬戶分散重復而導致大量預算資金滯留在預算單位的傳統問題及其帶來的壹系列弊端。從這個意義上說，零余額賬戶的有效管理是實現改革目標的關鍵。
百度百科-零余額賬戶