首先，清理池塘。
每年冬天，魚出塘後，排幹塘水，修補塘脊，拔除塘邊雜草，挖出多余淤泥，使塘底凍結，暴曬約1周。這樣可以疏松池塘土壤表層，改善通風條件，加速土壤中的有機物向養分轉化，達到消滅病蟲害的目的。？
第二，藥物清塘。
池塘裏除了養殖的魚，還經常混養著野生的魚蝦和各種生物，如細菌、蝸牛、貽貝、泥苔、水生昆蟲等。其中壹些會導致魚類生病，另壹些是病原體的載體，還有壹些會直接傷害養殖的魚類。藥物清池可以起到除野、除病原體的作用，是預防魚病的重要措施。
池塘清理常用的藥物有生石灰、漂白粉、茶餅、氨水等。其中生石灰、氨水、漂白粉在清理池塘方面有很多優勢。生石灰不僅能殺滅病原體、中間宿主、攜帶病原體的動物和池塘中的敵人，還能改善土壤、水質和施肥。氨水、漂白粉、生石灰有同樣的殺滅作用，氨水也有施肥作用。茶餅的殺菌作用不大，防病效果略差。？
用生石灰清理池塘有兩種方法。壹種是用幹塘清理池塘。先排幹塘水或留水深5-10 cm，每畝用生石灰50-75 kg(如果淤泥太多，生石灰可增加10%左右)。清理池塘時，在池塘底部挖幾個小坑，或者用木桶等。，加水溶解生石灰，立即均勻撒在四周(包括堤腳)不要冷卻。第二天早上，最好用耙子把塘泥搬開，達到更好的消毒效果。另壹種是用水清洗池塘。平均每畝水深1m，使用生石灰120-150kg。通常，將生石灰溶解在木桶或水箱中，並立即灑滿池塘。7-8天後，藥物消失，魚就可以放生了。由於水的硬度，生石灰會與鎂等發生反應。用清水清池比用幹池好，但生石灰用量大，成本高。用生石灰清理池塘，能迅速殺死野生魚類、各種蟲卵、水生昆蟲、寄生蟲和致病菌等。而且由於遊離堿，可以發生中和反應，改變酸性環境，使池塘呈微堿性，同時增加鈣含量，為水生動植物提供營養。