計提水利基金會計分錄做法如下：
首先，將計提水利基金的金額計入稅金及附加科目和應交稅費科目。當月期末結賬，將稅金及附加科目余額結轉到本年利潤科目。接下來，將本年利潤科目余額結轉到未分配利潤科目。最後，實際繳納水利基金，沖銷應交稅費科目，操作完成。
水利建設基金是專項用於水利建設的地方性政府基金，水利建設基金應按照銷售收入的0.1%來計算和繳納。水利建設基金申報時計稅依據是營業收入、水利建設基金是專項用於水利建設的政府性基金，對於企業來說，計入到稅金及附加科目進行核算。
關於水利基金的介紹
為加快水利建設步伐，提高大江大河防洪抗旱能力，改變重點水利工程設施和江河防洪體系建設滯後的狀況，緩解水資源供需矛盾，促進社會經濟持續、快速、健康發展，根據國務院建立水利建設基金的決定，制定本辦法。
中央水利建設基金主要用於關系國民經濟，和社會發展全局的大江大河重點工程的維護和建設。地方水利建設基金主要用於城市防洪及中小河流、湖泊的治理、維護和建設。跨流域、跨省（自治區、直轄市）的重大水利建設工程和跨國河流、國界河流我方重點防護工程的治理費用由中央和地方***同負擔。
以上內容參考：百度百科—水利基金