這壹制度的頒布，解決了長期以來民間非營利組織沒有適用的會計制度的問題，新制度有利於規範民間非營利組織的會計行為。與非營利組織以前適用的事業單位會計制度相比，筆者認為有幾個明顯的變化。
闡明會計原則。
《原制度》(事業單位會計準則第十六條)中規定:會計核算壹般采用收付實現制，但營業收入和支出核算可采用權責發生制。“如果非營利組織采用收付實現制會計，雖然具有簡便、直觀反映預算執行情況、人工成本低等優點，但不利於真實、完整地反映其財務狀況、經營活動和現金流量，難以為會計信息使用者提供足夠的對其決策有用的信息。因此，新制度第七條規定“會計核算應當以權責發生制為基礎”。新制度明確采用權責發生制進行會計核算，這將大大增加民間非營利組織會計信息的有用性，有助於減輕受托責任。比如在權責發生制下，通過設置遞延、計提、配比、攤銷等會計科目；提取固定資產折舊和無形資產攤銷，提取資產減值準備；對於已發生減值的短期投資、應收賬款、存貨、長期投資等重大資產項目，計提資產減值準備，確認減值損失，計入當期費用；設置“待攤費用”和“預提費用”賬戶，攤銷期間費用；對資產、負債、凈資產、收入和費用產生重大影響，進而影響財務會計報告使用者做出合理判斷的重要會計事項，按照規定的會計方法和程序進行處理，並在財務會計報告中充分披露，能夠正確確認各會計期間的收入、成本和費用，遵循謹慎性和重要性的要求，滿足會計信息使用者的信息需求。有助於民間非營利組織加強資產負債管理和成本管理，提高經營績效，有效彌補收付實現制會計的不足。
會計計量基礎中引入了公允價值。
新制度在堅持以歷史成本為計量基礎的同時，對壹些特殊交易引入了公允價值等其他計量基礎，如接受捐贈無形資產、接受捐贈短期投資、長期股權投資、通過非貨幣性交易置換長期股權投資業務捐贈、政府補助等。這主要是由於民間非營利組織的業務特點。他們的很多資產都是沒有實際成本獲得的，比如捐贈的資產，政府補貼的資產，都是無償獲得的。如果嚴格遵循實際成本原則，就很難對其進行確認和計量，從而難以達到真實、完整反映的目的。
五個會計要素對“支出”或“費用”的確認存在差異。
事業單位會計制度按照資產、負債、凈資產、收入、支出五個會計要素進行會計分類，設計會計報表結構。新制度以資產、負債、凈資產、收入和費用五個會計要素為基礎，設計會計報表的結構。因為民間非營利組織的資源提供者既不享有組織的所有權，也不從中獲得回報，所以民間非營利組織不存在核算“所有者權益”和“利潤”的問題。同樣，在權責發生制會計下，不存在收付實現制會計下的“支出”問題。因此，新制度既沒有企業會計中的所有者權益和利潤核算要素，也沒有事業單位會計中的“支出”核算要素。
非營利組織在業務活動中發生的各種費用或損失，在事業單位會計制度中稱為“支出”，在非營利組織會計制度中稱為“費用”。事業單位支出包括業務支出、經營支出、對所屬單位的補助、上繳支出和基本建設支出。民間非營利組織的費用大部分是消耗性費用，除業務活動成本外，相當壹部分費用是無法補償的。按其功能可分為經營活動成本、管理成本、籌資成本和其他費用。