福建農業職業技術學院開設的專業有：農業生物技術、食品質量與安全、食品加工技術、食品生物技術、環境工程技術、食品營養與檢測、寵物養護與馴導、畜牧獸醫、動物醫學、動物防疫與檢疫等，具體情況如下：
壹、生物技術學院
農業生物技術，食品質量與安全，食品加工技術，食品生物技術，環境工程，食品營養與檢測。
二、動物科學學院
寵物養護與馴導，畜牧獸醫，動物醫學，動物防疫與檢疫。
三、信息技術學院
動漫制作技術，計算機應用技術，物聯網應用技術，電子商務，計算機網絡技術，移動商務。
四、經濟管理學院
市場營銷，金融管理，統計與會計核算，物流管理，投資與理財，會計，互聯網金融，審計，連鎖經管管理。
福建農業職業技術學院的前身與校訓：
1、前身。
福建農業職業技術學院是福建省教育廳直屬的省內唯壹的農類全日制綜合性高等職業院校。學院於2003年2月經福建省人民政府批準，由福州市農業學校和福建省農業學校合並設立；前身可追溯至福建農桑總局蠶務學堂。
2、校訓
學院秉承百年優良辦學傳統，在“厚德強技，學以致用”的校訓和“艱苦奮鬥，自強不息，敬業奉獻，和諧發展”的農院精神指引勉勵下，現已發展成為以“農類”專業為優勢和特色，財經、電子、建築等專業協調發展的綜合性高等職業院校。