根據人民政府網站，文昌市衛生系統會計管理站屬於文昌市衛生計生委二級單位，隸屬於會計科。
衛生計生委，隸屬於同級地方政府，是衛生計生委。由原衛生局和人口計生委合並而成，主營業務為衛生防疫、醫院管理和計劃生育。