財務會計與預算會計的區別是核算主體的微觀性、核算過程的復雜性、核算目的的營利性等。
1、核算主體的微觀性。
企業財務會計是以某壹企業為主體，核算內容只能是本企業所發生的經濟活動，壹切與本企業經濟活動相聯系的、應歸屬於對方的核算內容，則不應該在本企業進行核算，這也是企業會計主體內在的質的規定；而預算會計是以整個國家預算執行為中心來組織核算，它既要核算各個非物質生產部門的預算收支情況，也要核算物質生產部門的經濟效益和利稅上繳情況。
2、核算過程的復雜性。
財務會計的核算過程要涉及供應、生產、銷售三個過程，而且每壹過程都涉及收付兩個方面，核算過程復雜；而預算會計的核算過程只涉及預算收入和預算支出兩個方面，沒有生產和銷售環節，核算過程相對簡單。
3、核算目的的營利性。
企業財務會計核算的最終目的，就是通過核算，使企業以最少的資金耗費，取得最大的經濟效益；而預算會計核算的目的在於體現預算收支政策的執行情況，不在於營利。
聯系是財務會計和預算會計存在著***同的會計主體，即部門和部門之間(包括履行政府職能的事業單位)，而且就會計對象而言，都要對部門的財政資金的運動情況進行反映，二者應在相當長的時期內並存，而且預算會計並不隨之取代，而是應該加強。