學院下設經濟貿易學院、財務管理學院、信息工程學院、農學院、動物科技學院、制藥工程學院、機電工程學院、社會人文學院、基礎部、培訓部等八院二部，設有農、工、文、管各類應用性短缺熱門專業53個。
專業設置 序號專業名稱學院1報關與國際貨運經濟貿易學院2國際經濟與貿易3酒店管理4旅遊管理5物流管理6農業經濟管理7市場營銷8財務管理（註冊會計師）財務管理學院9工程造價10會計電算化11會計與審計12計算機應用技術信息工程學院13軟件技術14電子商務15動漫設計與制作16計算機網絡技術17建築裝飾工程技術18焊接技術及自動化機電工程學院19模具設計與制造20汽車技術服務與營銷21機電壹體化技術22數控技術23新能源應用技術24電氣自動化技術25食品加工技術食品工程學院26食品分析與檢驗27營養與食品衛生28畜牧獸醫動物科技學院29寵物養護與疫病防治30獸醫（執業獸醫師）31動物防疫與檢疫32應用韓語（商貿方向）人文藝術學院33新聞采編與制作34商務英語35裝潢藝術設計36廣告設計與制作37作物生產技術農學院38綠色食品生產與經營39生物技術及應用40園林技術41園藝技術42水利工程43生物制藥技術制藥工程學院44藥品經營與管理（執業藥師）45藥品質量檢測技術46藥物制劑技術47中藥制藥技術 學院擁有教師547人，副教授以上高級職稱教師145人，省級學術帶頭人26人，中級職稱教師152人，“雙師型”教師116人，具有註冊執業資格的教師22人，具有碩士學位教師78人（其中國外留學歸來的教師15人）。
國家級教學團隊：綠色食品生產與經營專業教學團隊（杜廣平） 近年來，教師在省級以上刊物上發表論文600余篇，主編主審參編國家規劃教材100多部，主持和完成省市級以上的科研課題60余項，獲省市級科研成果獎20余項，培育作物新品種2個，省級精品課程3門。
重點建設專業及其專業群壹覽表 序號重點建設專業級別專業群帶動專業1作物生產技術央財支持種植類園藝技術種子生產與經營植物保護2食品加工技術央財支持農產品加工類農畜特產品加工食品分析與檢驗3農業經濟管理央財支持管理類財務管理物流管理市場營銷4畜牧獸醫地方財政養殖類獸醫動物防疫與檢疫特種動物養殖國家級、省級教學改革試點專業壹覽表 序號系(部)名稱試點專業名稱批準時間批準文號級別試點實施起止時間1經濟貿易系農業經濟與管理2003.1教高函字40號國家級2003.1-2006.122綠色農業系綠色食品生產與經營2002.11黑教高函字40號省級2002.11-2006.123制藥系生物制藥技術2002.11黑教高函字40號省級2002.11-2006.12精品課程 課程名稱負責人批準時間級別《農產品營銷》聶洪臣2010年國家級《春小麥栽培技術》許紀發2010年國家級《大豆栽培技術》杜廣平2009年國家級《山特產品加工與檢測技術》李鳳玉2010年教育部教指委《玉米栽培技術》邰連春2010年教育部教指委《數控車削加工》閆瑞濤2010年省級《大豆栽培技術》杜廣平2009年省級《春小麥栽培技術》許紀發2009年省級《農產品營銷》聶洪臣2009年省級《山特產品加工與檢測技術》李鳳玉2009年省級《養蜂技術》馮永謙2008年省級《作物栽培技術》張艷紅2008年省級《國際貿易實務》聶洪臣2008年省級《藥用化學》楊麗敏2007年省級《經濟法》王立波2007年省級《藥物制劑技術》韓瑞亭2007年省級《統計實用技術》胡寶珅2007年省級《基礎會計》張春霞2006年省級《網絡營銷》張麗霞2006年省級《經濟學基礎》李國政2005年省級《VB程序設計》薛永三2004年省級《植物學》杜廣平2003年省級實訓基地 學院擁有全國高等職業教育中實力雄厚的產業化校內實藥廠具有5大系列35個品種的；農業高科技示範園區、生物技術研究中訓中心、數控機電實訓中心、信息工程實訓中心、財務管理實訓中心、經濟貿易實訓中心、中心等校內實訓基地實力雄厚，還與周邊各企事業單位建立了50處相對穩定的校外實訓基地。
現為中國職業技術教育研究會會員單位、全國高等職業教育教學工作研究會理事單位、省振興老工業基地研究會常務理事單位、省制藥技術人才培訓基地、省農村信息人才培訓基地、數控機電行業人才培訓基地、牡丹江傳媒集團影視動畫制作公司產品研發生產與人才培養基地。 學院榮譽 建校以來，先後被農業部、教育部、省委、省政府授予A等壹級學校、教育改革先進單位，省級文明單位、省級花園式單位、省級綠色學校、省級綜合治理先進單位、省高校安全保衛工作先進單位、全省畢業生就業工作先進集體等榮譽稱號，05年被中國教育科學研究院等單位聯評為中國壹流高職院校。 校園芍藥文化節
芍園在著名養蜂專家韓行舟教授30余年的辛勤選育下，目前己有120多個新株型，成年株芍藥3000余株，實生苗壹萬多株。由此，賞芍人喜歡把育花人美譽為“芍藥老人”，他是術業有專攻的典範，言傳身教帶出了壹支可持續發展的芍藥培育團隊。芍藥雅潔平淡的美，展示出超凡脫俗、卓然獨立的品格，與農經人淡泊豁達、自強不息的性格相契合，尤其寒地芍藥的堅韌和美麗，就如同堅守在農職戰線上的農經人，堅毅、執著，富有魄力，目標高遠！在這農經院花每年盛開之時，學院都舉辦系列文化活動，農經校園芍藥文化節已經成為文化匯聚、交流的平臺，並日漸成為牡丹江市民的節日，六月賞芍已成為百萬市民的精神大餐。 學院建有英語協會、文學社、攝影協會、舞蹈協會等十幾個學生社團，經常舉辦公關禮儀、應聘技能等知識講座，定期開展業余黨校、演講賽、辯論會、技能操作、大學生藝術節和職業生涯設計大賽等實踐活動。05年7月，該院參加全國第壹屆大學生藝術展演獲得優秀組織獎，是我省唯壹壹所高職院校獲獎單位，學院舞蹈《東方紅》獲省級壹等獎、國家三等獎，並到人民大會堂參加匯報演出。