在電算化條件下，會計主管主要負責組織管理本單位的會計電算化工作，確定會計人員的崗位安排和分工權限，全面負責本單位會計電算化的數據安全保密、部門的工作進度、系統的穩定性和可靠性、數據安全以及計算機和會計軟件系統運行的協調工作。系統管理員負責本單位會計電算化的具體技術管理，包括會計軟件系統所涉及的軟硬件的使用、管理和維護。
壹般情況下，賬戶主管和系統管理員應該由兩個人分別擔任，尤其是實現條件的會計軟件。從軟件的規模、電算化工作的強度和會計業務的工作量來看，都要求有專門的系統管理員負責。當然，在單位會計人員不多，會計業務量不大，會計軟件單機運行的情況下，也允許會計主管和系統管理員為壹人。無論從會計工作的分工、工作、責任等方面來看。，客戶經理是本單位業務的總負責人，系統管理員要服從會計主管的工作安排。系統管理員的權限不是無限的，他做的所有工作都要對會計主管負責。