有三個校區，三個有本科生的校區分別是：
1、金山校區，也就是校本部，在福州倉山區。
2、旗山校區，在福州閩侯縣大學城。
3、安溪茶學院校區。在泉州安溪縣。
安溪校區開設有專業茶學、商務經濟學、管理科學、會計（茶學院）。
旗山校區專業則有工程管理、土木工程、交通工程、森林工程、物流工程、材料科學與工程、化學工程與工藝、木材科學與工程、輕化工程、新能源科學與工程。
金山校區除了上述其它專業4年都在金山校區（本部）。
學科建設：
截至2016年11月，學校***有2個國家重點學科、2個農業部重點學科、7個國家林業局重點學科，9個福建省特色重點學科、21個福建省重點學科和3個省級優勢學科平臺。
在全國第三輪學科評估中，1個學科進入全國前5名，4個學科進入全國前10名（植物保護、林學、林業工程、風景園林學），8個學科進入全國前20名，均占福建省屬高校50%左右，排名第壹。截止2021年5月，學校植物學與動物學、農業科學、化學、環境科學與生態學、工程學等5個學科進入ESI全球排名前1%。
學校設有11個壹級學科博士點，25個壹級學科碩士點，11個博士後科研流動站，碩士專業學位授權點10個（覆蓋23個領域）。