1、核算所實現的目標方向不同。稅務會計所實現的目標是在稅法的規範下為企業籌劃納稅形式，並實施納稅籌劃、計算、申納稅款等稅務活動;財務會計的目標是客觀、公正地反映企業的財務狀況、經營成果及資金變動情況。
2、核算對象不同。稅務會計核算的對象是企業涉及到稅收部分的財務數據，例如企業的經營收入及利潤等，為企業核算應繳稅款然後進行稅款的繳納;相比起稅務會計，財務會計核算的是企業全部的資金運動。
3、核算依據不同。企業期末核算，稅務會計需要借助於財務會計的數據資料，按照稅法規定進行調整數據以編制納稅申報表及調整後的財務報表。財務會計則根據會計法、根據企業的數據資料編制相應的財務報表。
4、會計要素不同。稅務會計的要素有應稅收入、扣除費用、納稅所得和應納稅額四項。這裏的應稅收入、扣除費用和財務會計中的收入、費用不同，在確認的範圍、時間，計量標準和方法上都可能發生差異;財務會計有六大要素，即資產、負債、所有者權益、收入、費用和利潤。這六大要素是會計對象的具體化，財務會計所是反映的內容圍繞六要素進行的。
5、對會計上的穩健原則態度不同。稅務會計壹般不對未來損失和費用進行預計，只有在客觀上證據表明已發生的情況下方可確認;財務會計實行穩健原則，壹般充分預計可能的損失和費用，而不預計可能的收入，使財務報表所反映的財務狀況和經營成果不被報表使用者誤解。