總體來說這兩類（事業編制，人事代理編制）人員在工資、保險、福利待遇上並沒有本質的區別！但兩類人員在身份上有本質的區別：
事業單位行政編制，檔案在人事組織部存放；
事業單位的老職工是是事業編制，檔案在人事局存放；
事業單位的新近人員（必須是人事部門與事業單位主管部分***同組織的公考招考進入的有些單位碩士按引進人才可以免考）也是事業編制，但只是占有編制，但編制不具體到某個人，其檔案在人事局主管的人才交流中心托管，實行人事代理。
除了上面兩種還又第三種那就是事業單位自己招聘的人員（即：沒有通過人事部分、與單位主管部分的批準）無編制，雖然也與單位簽訂合同，但僅僅充其量也就是勞動合同而已