第壹：金稅三期的推廣和應用，金稅三期會慢慢地深入，產生的的數據會慢慢被監管部門利用，由於我國有協稅制度，多部門使用***同的數據。
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第二：網上報稅的VPDN隨著金稅三期的使用，逐步被互聯網報稅系統替代，這樣系統自動報稅成為可能，那麽從記賬憑證的填制開始，到會計核算，到報表的生成，到網上報稅，可以實行全自動模式，那麽代理記賬公司、兼職會計將來何去何從?
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第三：金稅三期推廣後，除了工資和壹些結轉憑證的原始憑證外，剩余的原始憑證可以直接從系統調取，那麽除了審核工作外，還有多少工作量需要人工去完成?
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第四：金稅三期對增值稅專用發票采用是全要素認證，這樣發票在企業之間
就會必然有邏輯相符的印證，以後虛開和模糊開必然會遭受稽查
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第五：金稅三期申報系統，個稅和社保兩個申報系統是否會相互監督和關聯，這勢必影響企業的社保成本，現在個稅大家交沒有問題，關鍵是企業社保負擔太重，壹旦這兩個系統關聯，很多企業會選擇消失。
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第六：金稅三期應用後，稅務稽查需要大力改革，稅務稽查現在是事後稽查，這無疑成為企業家和會計心中的壹把刺，很多偷稅漏稅行為，不壹定就是故意，所以稅務稽查也應該從事後轉到事前，利用金稅三期掌握的企業數據，進行事中稽查，還有應該盡快推出企業財務稅務的安全預警診斷系統，讓企業財務在申報前自我診斷，這樣既可以減少稅務稽查成本，也有利規範企業財務
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第七：金稅三期實行後，企業無紙化財務將會逐步推廣，數據***享是必然，會計工作量會大量減少，這樣大量的會計人員會轉型到財務，在企業內部做專項核算，很多企業會最終推行責任核算。
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第八：由於金稅三期的應用，也要求會計防範風險從事後轉到事前，迫使很多企業財務去熟悉業務，走上和業務相結合的道路