另外，變量* * *的線性問題也是壹個難題。在實證研究過程中，由於變量之間基本關系的復雜性，可能會衍生出變量的線性問題，即某些變量作為壹組變量具有顯著的相關性，但如果試圖分解壹個變量進行獨立檢驗，可能很難分解，或者可能不再具有相關性。例如，Kelly在實證研究中發現，通過債務變量進行的財富轉移並不是獨立的，債務權益比、可支配資金余額和現金流方差等幾個債務變量往往存在* * *線性問題，這使得人們在解釋檢驗結果時很難區分它們對單個變量的影響。實證會計研究非常強調“價值中立”，期望不偏不倚地研究會計問題，反對任何帶有個人偏好或價值傾向的會計理論研究。但事實上，要做到完全的“價值中立”基本上是不可能的，因為研究者在選擇研究課題、樣本、方法和建立研究假設的過程中，必然會涉及到研究者的價值判斷。此外，會計信息具有經濟後果。會計研究者作為“經濟人”，在實證會計研究過程中無法完全避免個人好惡帶來的先入為主的幹擾，因此絕對的“價值中立”難以實現。
此外，正是由於研究者的價值觀不同，研究中選取的數據樣本與證明模型不同，有的甚至相互對立，缺乏可比性和嚴謹性，導致同壹問題結論的多樣化，不僅沒有解決問題，反而使問題復雜化。實證會計研究試圖通過大量可重復的驗證材料來支持和解釋壹種會計理論。因此，與規範會計研究相比，實證會計研究必須有足夠的樣本數據進行實證分析後才能得到驗證，所以存在時滯。