1980年，南洋大學和新加坡大學合並成立新加坡國立大學。
1981年，新加坡政府在南洋大學校園內成立南洋理工學院，為新加坡經濟的快速發展培養工程專業人才。
65438-0985南洋理工學院被英聯邦工程理事會授予全球最傑出工程學院之壹。
1987成立會計與商業學院，現已發展成為國際知名的南洋商學院。
1988，應用科學學院成立。
1991南洋理工大學重組，國立教育學院並入其中，更名為南洋理工大學，成為其獨立學院。
1992，傳播學院成立。
1995，會計與商業學院更名為南洋商學院。
1996，南洋大學校友記錄轉到南洋理工大學保存。
2000年，應用科學學院重組為計算機工程學院和材料工程學院。
2001，生物科學學院成立。同年，土木及結構工程學院改名為土木及環境工程學院。
2003年，九層的科技大樓落成，是在校園裏迸發創造力的科研溫床。* * *擁有4個跨學科科研走廊和6個科研中心；與斯坦福大學建立戰略聯盟，共同舉辦環境科學與工程研究課程；引進新制度，讓專科生早入學。
2004年啟動本科生研究計劃，讓以學術研究為主的本科生有機會參與各種研究項目；采取自主招生標準，擁有自主招生10%新生；與新加坡體校實施計劃，為體校學生策劃突破性的壹條龍綜合課程；成立人文社會科學學院，開設經濟學榮譽文學士學位，開設中文、英文、經濟學、心理學、社會學輔修課程；開設三門全新的本科課程:化學與生物分子工程學位課程、計算機科學學位課程和海洋研究學位課程；成立中國戰略辦公室和印度戰略辦公室；與康奈爾酒店管理學院簽約成立康奈爾-南洋酒店管理學院，提供聯合碩士學位課程。
2005年，慶祝建校50周年；在英國《泰晤士報高等教育增刊》全球200所最佳大學排行榜中，再次躋身前50名，排名第48位；全球科技類大學排名第26位；人文社會科學學院開設綜合學位課程；藝術、設計與傳媒學院和理學院的學位課程開課；機械與制造工程學院更名為機械與航空航天工程學院，新成立的航空航天工程系開設了新加坡第壹個航空航天工程學位課程。材料工程學院更名為材料科學與工程學院；附屬工程學院生物工程系、化學與生物分子工程系合並為化學與生物醫學工程學院；建立高等研究院；在北京中關村和上海張江高科技園區設立辦事處；與歐洲最大的公共研究機構法國國家研究中心簽署合作協議。
2006年，學校正式獨立，由法定機構轉為非營利性企業；舉辦中國首屆海外畢業典禮，慶祝中國留學生順利畢業；將12學院重組為工、理、商、文四所學院；設立楊振寧精英計劃；啟動全球暑期學習項目；位於新加坡新研究區中心的魏壹校區正式開放。傳播與信息學院正式更名為黃金輝傳播與信息學院；新成立的拉惹勒南國際關系學院是13學院，是壹個獨立的研究機構。高級智庫國防與戰略研究所將繼續作為拉惹勒南國際關系研究所下屬的主要研究機構。
2007年，學校的第二個校區——魏壹校區和校友俱樂部正式開放。學校計劃在新校區設立研究生院；成立環境與水資源研究所；“學校優秀畢業生獎”正式啟動；成立本科教育委員會；在雅加達、孟買、上海、北京、山東成立校友會；國家研究基金會為學校提供2000萬元經費，用於推動環保和凈水的研究，為新壹代電子技術的發展提供媒介；設立“南洋助理教授”計劃；該校孔子學院開學。