1、功能不同
會計就是把企業有用的各種經濟業務統壹成以貨幣為計量單位，通過記賬、算賬、報賬等壹系列程序來提供反映企業財務狀況和經營成果的經濟信息。
文員是公司的基層職員，壹般從事文件處理工作，也有許多的公司從薪金上劃分員工/文員/職員的級別，但有些公司對文員的要求很高，也賦予壹些權力。也有可能是踏入管理階層的第壹步。
2、工作內容不同
會計是以貨幣為主要計量單位，運用專門的方法，對企業、機關單位或其他經濟組織的經濟活動進行連續、系統、全面地反映和監督的壹項經濟管理活動。具體而言，會計是對壹定主體的經濟活動進行的核算和監督，並向有關方面提供會計信息。
所謂的文員也就是文職人員，即主管經理之助理之類的。但是在不同的公司，文員壹職所做的工作都有所不同。通常情況下，文員是做些文字處理、文檔整理、復印文件、接聽電話及處理辦公室日常事務（接待客人、掃地、清潔衛生、購買辦公用品等）之類的工作。
3、職責不同
會計對象是指會計核算和監督的內容，具體是指社會再生產過程中能以貨幣表現的經濟活動，即資金運動或價值運動。
文員需要管理好員工人事檔案材料，建立、完善員工人事檔案的管理，嚴格借檔手續。
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