內部審計的作用是內部審計職能的外在表現。內部審計在企業管理中的作用，是內部審計部門行使審計職能、完成審計任務，在實現審計目標過程中（或之後）產生的客觀效果。
1、 制約作用
內部審計通過對企業經濟活動及其經營管理制度的監督檢查，對照國家的法律法規和企業的規章制度，按照審計工作規範，揭示企業的違法亂紀行為，維護企業的經濟秩序。主要有以下四個方面：
（1）、制止違規違紀現象，保護國家財產和企業利益。
通過檢查監督被審計單位執行國家財經紀律情況，制止違規行為，有利於企業健康發展。
例如，山東齊魯増塑劑股份有限公司審計科自成立以來，開展財務收支審計，查出不合規問題15項，金額達305萬元，均按照國家法律作了整改或上繳財政。有效地防止了違法違紀行為的產生，維護了財經紀律，教育了財務人員，為今後細化管理奠定了基礎。
（2）、披露經濟活動資料中存在的錯誤和舞弊行為，保證會計信息資料真實、正確、及時、合理合法的反映事實。糾正經濟活動中的不正之風。事實上不少單位的信息資料不僅存在錯誤，而且存在著具有造假性質的“賬外賬”和“兩本賬”及私設小金庫現象，因此，有必要強化內部審計監督，查錯防弊，提高會計和審計人員的業務素質。
（3）配合紀檢監察部門，打擊各種經濟犯罪活動
內部審計部門通過開展財務收支審計、財經法紀審計、領導幹部離任審計，發現問題，查明損失浪費、貪汙腐化行為，及時向紀檢監察部門提供證據和信息，采取措施，充分發揮審計的“經濟警察”的特殊作用。
2、 防護作用
內部審計工作在執行監督職能中，對深化改革，降本増效起到了保證、保障、維護作用。
（1）、為建立健全高效的內部控制制度提供有力保證。
為了適應WTO環境下的新形勢，應對激烈的市場競爭，內部審計人員有必要開展事前、事中、事後審計，內控系統的健全性和有效性審計，風險審計及計算機審計，揭示並建議改正內部控制制度存在的薄弱環節和失控點，提高企業管理水平。
（2）、保障國有資產的安全、完整。
內部審計人員應重視生產經營情況，對企業資產狀況做到心中有數，隨時隨地開展內部審計督查，提出有效措施，經濟有效的使用資產，確保國有資產保值增值，防止國有資產流失。
（3）、降本增效，維護財經紀律。
有效地開展經濟效益審計是當前企業內部審計工作的重點和關鍵。降低成本增加效益，維護財經紀律是經濟效益審計的出發點。
例如：山東齊魯増塑劑股份有限公司審計科自1989年建廠初期就開始實行外委工程審計監督工作，成效顯著。審查了公司建設的全國性的大型工程項目DOP四萬噸、DBP二萬噸、810酯、山東増塑劑技術開發中心中試裝置DOS、DOA項目、兩萬噸苯酐等基建工程項目及日常防腐工程、檢修工程、粵港城大酒店、兔巴哥食品公司等外委工程項目，審查工程結算5700份，審查總價值53340.15萬元，審定值45520.30萬元，審減值7819.85萬元。通過審計工作的開展，不但節約了資金，減少了資金流失，降低了工程成本，提高了經濟效益，而且維護了財經紀律的嚴肅性。成績得到了上級審計部門的肯定。
3、 鑒證作用
（1）、開展聯營審計，維護企業合法權益。
聯合經營是在生產社會化和市場經濟不斷發展的情況下，企業為了取得實效，壹個企業和壹個或數個企業為發展生產和產品交換而進行的經濟聯系。山東齊魯増塑劑股份有限公司就是壹個由齊魯石化公司與臨淄區政府各投資50%而組建的聯營企業。從公司建立到目前為止，雖曾壹度效益較好，1992-1996年人均經濟效益列淄博市工業企業第三位，躋身於中國化工500強，但隨著俄羅斯及西方國家増塑劑產品的大量低價進口沖擊，1997-2000年效益下降，有的月份出現了虧損。由於我們加強了聯營企業財務收支審計工作，遏制了亂攤亂擠成本現象，審計科提出了壓縮公司辦公費用和車輛維修費用、出售辦公用車、優化生產原料丁辛醇和苯酐的采購辦法和采購方式等建議，降低了成本和消耗，規範了聯營企業財務核算辦法，投資雙方的合法利益均得到了保證。
（2）、開展任期內經濟責任審計和領導幹部離任審計，強 化 內部監督機制。
實行領導班子在任定期審計，有助於監督企業領導依法辦事，遏制腐敗，促進企業廉政建設，為上級主管部門和政府考察提拔幹部提供依據。