上市公司年報中財務會計報告的主要內容包括審計報告、會計報表和會計報表附註。
上市公司被出具拒絕表示意見或者否定意見的審計報告的，審計報告全文、會計報表以及報表附註全文將刊登在年度報告摘要中。上市公司被出具帶解釋性說明或保留意見的審計報告的，完整的審計報告、會計報表以及與解釋性說明或保留意見有關事項的相關說明將在年度報告摘要中刊登。
上市公司應當按照《會計報表附註指引》編制會計報表附註。會計報表附註包括外幣核算方法、壞賬核算方法、存貨核算方法、短期投資核算方法、長期投資核算方法、固定資產計價和折舊方法、收入確認原則、所得稅會計處理方法、合並會計報表編制方法、會計政策、會計估計變更、控股子公司和合營企業及公司的承諾(或有事項)。