行政單位會計組織壹般按機構建制和經費領報關系，分為主管會計單位、二級會計單位和基層會計單位等三級。
1、 主管會計單位
主管會計單位是指向同級財政部門領報經費，並發生預算管理關系，有下壹級會計單位的行政單位。
2、 二級會計單位
二級會計單位是指向主管會計單位或上壹級會計單位領報經費，並發生預算管理關系，有下壹級會計單位的行政單位。
3、基層會計單位
基層會計單位是指向上壹級會計單位領報經費，並發生預算管理關系，沒有下級會計單位的行政單位。向同級財政部門領報經費，沒有下壹級會計單位的，視同基層會計單位。
主管會計單位、二級會計單位和基層會計單位實行獨立會計核算，負責組織管理本部門、本單位的全部會計工作。不具備獨立核算條件的行政單位，實行單據報賬制度，作為“報銷單位”管理。