1、獨立審計的自願性需求不足。在我國，審計服務的最大需求者是政府部門，而不是政府以外的各種利益相關者。但是，政府部門對財務報表鑒證質量的關註程度要低於其他利益相關者，審計部門為了獲得生存空間，不惜通過向某些業務單位支付介紹費、回扣等手段來取得業務，很難保證審計的獨立性；
2、公司治理結構缺陷。在直接審計委托模式下，包括企業所有者、註冊會計師和經營者三方。企業所有者是委托人，註冊會計師是審計人，經營者是被審計人，三者身份明確，形成相互制衡的審計關系。審計代理委托人可以通過選聘和審計付費來對註冊會計師施壓，使得註冊會計師的獨立性遭到破壞。